胞外DNA供体多样性调控细菌前噬菌体激活与同源重组删除的平衡

《The ISME Journal》：Intragenomic conflict between transformation and prophage explains taxon-specific DNA acquisition

　　

摘要

许多整合至染色体上的可移动遗传元件被RecA-DNA核蛋白丝激活，这可能是为逃避通过同源重组而被删除的一种适应性策略。与细菌转化有助于消除插入的病毒DNA这一观点一致，跨分类群比较发现，分离物的前噬菌体含量与同源重组速率呈负相关。检测胞外DNA池组成对溶原菌转化的影响表明，来自同种供体的DNA同时驱动了前噬菌体的激活和删除，而来自不同物种的DNA仅触发前噬菌体的激活。因此，水平DNA转移机制的速率在不同细菌生态体系中有所不同：当DNA来源于较少供体物种时，同源重组相较于前噬菌体积累更为普遍。