转录组学分析鉴定出与静脉血栓栓塞症复发相关的免疫相关簇及候选基因PPP2R1A

《Archives of Pharmacal Research》：Transcriptomic analysis identifies immune-related clusters and PPP2R1A as a candidate gene associated with venous thromboembolism recurrence

静脉血栓栓塞性疾病（VTE），包括深静脉血栓形成（DVT）和肺栓塞（PE），与高发病率、高死亡率及高复发风险相关。然而，VTE中与免疫相关的转录组异质性及复发相关分子特征尚未被完全阐明。本研究旨在探索与VTE复发相关的免疫相关转录组亚群，并筛选复发相关候选基因。研究分析了公共GEO数据集，以GSE19151作为发现队列，GSE48000用于外部验证。研究采用了共识聚类、WGCNA、差异表达分析、GO/KEGG富集分析以及基于随机森林的探索性基因筛选方法。此外，利用小鼠下腔静脉血栓模型及内皮细胞实验（包括Western blot、qRT-PCR、CCK-8、Transwell、流式细胞术及内皮-免疫共培养实验）进一步评估了*PPP2R1A*的功能意义。在VTE患者中识别出两种探索性免疫相关亚群。与亚型I相比，亚型II表现出更强的IFN-γ、单核细胞及IL-6富集，且复发比例更高（61.4% vs. 41.7%）。随机森林分析筛选出23个复发相关候选基因，其中包括*PPP2R1A*，尽管外部验证显示其区分能力有限（AUC = 0.615）。在实验体系中，*PPP2R1A*的表达与血栓负荷、内皮细胞增殖、迁移、凋亡、炎症激活及p-MEK/p-ERK信号通路的改变相关。这些发现确定了VTE中探索性的免疫相关亚群，并支持*PPP2R1A*作为与内皮MEK/ERK信号相关的复发候选基因。在将这些发现转化为临床生物标志物或治疗靶点之前，需要更大规模的前瞻性队列研究及细胞特异性机制研究进行验证。