尼日利亚拉各斯州养猪场饲料和粪便中真菌的分离、鉴定与表征

《BMC Microbiology》：Occurrence, molecular characterization and phylogenetic studies of fungal species in piggeries and implications for food safety

　　

摘要

背景

真菌是多样化的一组异养真核生物，在动物、植物和环境健康中发挥着重要作用。虽然某些存在于牲畜饲料中的物种有助于营养和生产率，但另一些会产生霉菌毒素，对动物健康、食品安全和公共卫生构成严重风险。本研究旨在分离、鉴定和表征尼日利亚拉各斯州注册和未注册养猪场饲料和粪便样本中存在的真菌物种。

方法

收集饲料（n?=?6）和粪便（n?=?12）样本，冷藏并在马铃薯葡萄糖琼脂（PDA）上于25?–28?°C培养4天。对纯培养物进行形态学鉴定，并提取DNA。PCR扩增靶向核糖体DNA的ITS区域，使用GenBank参考序列进行比对以进行物种鉴定。评估系统发育关系。

结果

结果表明，从注册和未注册农场收集的粪便（33.3% ??100.0%）和饲料（100%）中存在常见的真菌污染。从饲料中分离出属于曲霉属（Aspergillus）、毕赤酵母属（Pichia）、毛霉属（Rhizopus）和木霉属（Trichoderma）的微真菌，而从粪便中分离出曲霉属和念珠菌属（Candida）。分子分析显示分离株之间存在高度遗传相似性，其中黄曲霉（Aspergillus flavus）和根霉（Rhizopus arrhizus）与已知菌株显示出100%的一致性。四种进化模型产生了相似的系统发育树，将真菌物种归入支持度高的分支，仅在分支长度和自举值上存在微小差异。在注册和未注册农场的分离株之间未观察到显著遗传分化。

结论

所研究养猪场中潜在产霉菌素真菌的出现提供了基线数据，强调了广泛监测和监控对促进食品安全和保护环境健康的重要性。

临床试验编号

不适用。