可食用蘑菇菌丝共生细菌群落的菌株依赖性变异及其与菌丝生理特征的关联

《Microbial Ecology》：Mycelial Symbiotic Bacterial Communities and Their Associations with Mycelial Traits in Cultivated Edible Mushrooms

　　## 摘要可食用蘑菇菌丝体中栖息着多样的菌丝共生细菌群落（MSBCs），但这些群落在不同蘑菇菌株间的变异程度及其与菌丝生理特征之间的关系仍知之甚少。本研究调查了代表六个物种的八种可食用蘑菇菌株，以表征MSBC组成并探索其与菌丝生长、营养组成及胞外氧化酶活性之间的潜在关联。利用16S rRNA基因扩增子测序，我们发现细菌α多样性在各菌株间大体保守，Shannon指数和Simpson指数未检测到显著差异。然而，主成分分析显示细菌群落之间存在部分分离，PERMANOVA分析确认了菌株间MSBC整体结构的显著差异（R2 = 0.422，*p* = 0.001）。在所有菌株中，厚壁菌门、变形菌门、放线菌门和拟杆菌门为主要优势细菌门。包括*Tepidimicrobium*、*Acinetobacter*、*Enterobacter*、*Lactobacillus*和*Sphingomonas*在内的多个常见属在不同菌株间表现出不同的丰度分布，而LEfSe分析鉴定出了具有菌株区分性的细菌类群。种内比较表明，*Flammulina filiformis*和*Hypsizygus marmoreus*的近缘菌株保持了相似的α多样性，但表现出分化的细菌群落组成。冗余分析和Spearman相关分析进一步揭示了特定细菌类群与菌丝生长、营养组成和胞外氧化酶活性之间的显著关联。综上，这些发现表明MSBC由保守的优势细菌谱系和依赖于菌株的群落变异共同组成，并揭示了共生细菌组合与可食用蘑菇菌丝生理特征之间潜在的关联。