基于 OcBSA 与转录组联合分析挖掘酿酒葡萄种内耐寒候选基因

《Chemical and Biological Technologies in Agriculture》：Identification of cold-resistance genes in Vitis vinifera through integrated OcBSA and transcriptome analysis of an intraspecific hybrid population

【字体：大中小】 时间：2026年10月09日 来源：Chemical and Biological Technologies in Agriculture 5.8

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　　摘要背景低温伤害限制了Vitis vinifera的栽培，而传统的种间育种虽然可以提高耐寒性，但会牺牲果实品质。因此，需要高效地识别V. vinifera中的耐寒基因位点，以支持种内育种。我们分析了一个由耐寒的高品质品系‘Ecolly’和‘Mars

摘要

背景

低温伤害限制了Vitis vinifera的栽培，而传统的种间育种虽然可以提高耐寒性，但会牺牲果实品质。因此，需要高效地识别V. vinifera中的耐寒基因位点，以支持种内育种。我们分析了一个由耐寒的高品质品系‘Ecolly’和‘Marselan’杂交后代组成的F1群体。我们将杂交分离群体分析（OcBSA）与RNA测序（RNA-seq）相结合，并通过逆转录定量PCR（RT-qPCR）验证了差异表达的基因。

结果

杂交后代的耐寒性呈正态分布，这证明其适合用于基因定位。OcBSA将耐寒相关区域定位到12号、18号和25号染色体上。结合OcBSA和RNA-seq的结果，我们发现了43个功能注释的候选基因，这些基因在涉及氨基酸、碳水化合物、次级代谢物、能量和信号转导代谢的25个KEGG通路中富集。候选基因包括ASN1、MMT1、CYP73A4、GA2OX1、GA2OX6、SALR、GLO1、AGT1、MAN2和SAG113，以及MYB、bHLH和ERF转录因子。对六个差异表达基因的RT-qPCR分析结果与RNA-seq基本一致。CAB-151在S_1中的表达量较高，而PTI6在S_3中表达量最高，在耐寒组中则降低。