《ChemMedChem》:Synthesis, Antiparasitic Activity, and ADME Profile of Morpholinephenylbenzamides: A Pharmacological Study Against Chagas Disease and Visceral Leishmaniasis
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恰加斯病和利什曼病是被忽视的热带疾病,治疗选择有限。本研究报道了吗啉苯基苯甲酰胺类化合物的命中至先导(hit-to-lead)优化,从命中化合物1开始,该化合物对克氏锥虫(Trypanosoma cruzi)具有强效活性(IC50 0.2
恰加斯病和利什曼病是被忽视的热带疾病,治疗选择有限。本研究报道了吗啉苯基苯甲酰胺类化合物的命中至先导(hit-to-lead)优化,从命中化合物1开始,该化合物对克氏锥虫(Trypanosoma cruzi)具有强效活性(IC50 0.29–0.76 μM),对婴儿利什曼原虫(Leishmania infantum)具有中等活性(IC50 10.7 μM),尽管其ADME特征不理想。对24个新型衍生物的构效关系研究提供了关键的药效团见解。虽然克氏锥虫对化学修饰不太敏感,但化合物20表现出与苄硝唑(benznidazole)相当的效力(IC50 3.58 μM),且与化合物1相比,其选择性、亲脂性和溶解度显著改善。针对婴儿利什曼原虫,有6个衍生物保持了活性,其中化合物24的效力提高了1.5倍(IC50 7.6 μM)。此外,化合物16因其优异的ADME特征而突出,包括增强的渗透性和代谢稳定性。这些发现验证了吗啉苯基苯甲酰胺骨架作为具有双重抗寄生虫活性的稳健化合物类。
恰加斯病(Chagas disease)和内脏利什曼病(visceral leishmaniasis)属于被忽视的热带疾病,影响全球超过十亿人。恰加斯病由克氏锥虫(Trypanosoma cruzi,T. cruzi)引起,经锥蝽传播,全球感染人数超700万,但现有治疗药物仅有硝呋替莫和苄硝唑,存在寄生虫耐药、慢性期疗效有限、疗程长且副作用严重等问题。内脏利什曼病主要由婴儿利什曼原虫(Leishmania infantum,L. infantum)等引起,每年新增病例超100万,死亡2万–4万,现有药物如锑剂、两性霉素B等虽有一定疗效,但毒性高、费用昂贵且多为注射给药,患者依从性差。因此,迫切需要开发新型有效的抗寄生虫药物。研究人员基于前期高通量筛选获得的命中化合物1(一种吗啉苯基苯甲酰胺),发现其对T. cruzi(Tulahuen株)和L. infantum具有良好活性,但ADME性质不佳,包括溶解度低、渗透性差和代谢稳定性不足。为此,研究人员开展命中至先导优化,系统修饰苯甲酰胺、中央苯环和吗啉三个片段,旨在探索药效团、建立构效关系(structure–activity relationship, SAR)并改善类药性质。
研究人员设计并合成了24个新型衍生物,评价了其体外抗T. cruzi和抗L. infantum活性及细胞毒性,并对代表性化合物进行了体外ADME检测。结果表明:T. cruzi对化学修饰的耐受性较低,苯甲酰胺上的2,4-二甲氧基对抗T. cruzi活性至关重要;而L. infantum对部分修饰具有较高耐受性。化合物20(中央苯环三氟甲基替换为氟)对T. cruzi的IC
50为3.58 μM,与苄硝唑(IC
50 3.8 μM)相当,选择性指数(selectivity index, SI)高达264.3,且亲脂性和溶解度较命中化合物1显著改善;化合物24(吗啉位置异构体)对L. infantum的IC
50为7.6 μM,活性较1提高1.5倍,SI为81.3;化合物16(苯甲酰胺片段引入羟基吡啶)的抗寄生虫活性中等,但ADME特性优异,尤其在小鼠肝微粒体中代谢稳定性显著提升(半衰期101.93 min,而1仅为15.61 min),渗透性也大幅增强。此外,化合物1对T. cruzi不同离散分型单位(Discrete Typing Units, DTUs)的Y株和CL-Brener株显示出更高效力(IC
50分别为0.31和0.29 μM),表明其具有广谱抗锥虫活性。这些发现确证吗啉苯基苯甲酰胺骨架可作为双重抗寄生虫先导优化的稳健平台。
关键技术方法:研究人员采用芳香亲核取代、硝基还原和酰胺键形成(酰氯法或HBTU偶联)等合成策略制备衍生物;利用SwissADME平台计算clogP预测亲脂性。体外抗T. cruzi活性测定使用Tulahuen株(L929细胞)以及Y株和CL-Brener株(L6细胞),分别采用β-半乳糖苷酶报告基因法和发光法;抗L. infantum活性测定使用tdTomato转染的MHOM/BR/1974/PP75株感染THP-1巨噬细胞;细胞毒性采用刃天青还原法测定CC
50。ADME评价包括eLogD
7.4、动力学溶解度、平行人工膜渗透性(PAMPA)以及小鼠/人肝微粒体代谢稳定性,均通过LC–MS/MS定量分析。
2.1 合成与初始命中1的体外药理评价:通过两条合成路线获得化合物1,酰氯法产率更高(53% vs 29%)。1对T. cruzi的IC
50为0.76 μM(SI 109.5),对L. infantum的IC
50为10.7 μM(SI 36.3),但ADME差:logD 4.60,pH 2.0和7.4的动力学溶解度分别为4.10 μM和6.15 μM,PAMPA渗透性为0.78×10
-6 cm/s,小鼠肝微粒体半衰期仅15.61 min。
2.2 构效关系研究策略:基于1的结构,分别修饰苯甲酰胺、中央苯环和吗啉片段,使用clogP预测亲脂性,并移除潜在代谢软点(如甲氧基)以改善代谢稳定性。
2.3 苯甲酰胺片段修饰:去除或移动甲氧基导致抗T. cruzi活性完全丧失(IC
50 > 100 μM);对L. infantum,去除对位甲氧基可部分耐受(化合物8,IC
50 27.2 μM,SI 37.3)。将苯环替换为吡啶环并引入羟基得到化合物16,抗T. cruzi IC
50为12.5 μM,抗L. infantum IC
50为17.9 μM,且亲脂性显著降低(clogP 2.26)。引入3-吡啶基的化合物14保持抗L. infantum活性(IC
50 10.8 μM)并提高SI至100.7。
2.4 中央苯环修饰:将三氟甲基替换为氟得到化合物20,抗T. cruzi IC
50为3.58 μM(SI 264.3),与苄硝唑相当;抗L. infantum IC
50为12.8 μM。引入酯基或吡啶环导致活性丧失。氟原子移至5位(化合物23)对T. cruzi失活,但抗L. infantum活性保持(IC
50 10.4 μM,SI 103.2)。吗啉位置改变得到化合物24,抗L. infantum活性增强至7.6 μM(SI 81.3),但T. cruzi活性丧失。
2.5 吗啉片段修饰:去除吗啉环(化合物26)或替换为硫吗啉(27)、N-甲基哌嗪(28)均导致活性大幅下降或丧失,表明吗啉环对活性至关重要。N-Boc-哌嗪衍生物(29)对L. infantum活性与1相当(IC
50 10.4 μM,SI > 70),但抗T. cruzi活性弱。
2.6 化合物16和20的体外ADME特性:16的溶解度(pH 7.4为23.3 μM)和渗透性(15.7×10
-6 cm/s)较1显著改善,小鼠肝微粒体代谢稳定性优异(t
1/2 101.93 min,Cl
int 27.20 μL/min/mg);20的溶解度(18.97 μM)和渗透性(15.1×10
-6 cm/s)也提高,但小鼠代谢稳定性差(t
1/2 6.24 min,Cl
int 444.40 μL/min/mg),说明苯甲酰胺上的甲氧基是主要代谢软点。16在人肝微粒体中同样保持良好稳定性。
2.7 化合物1对不同T. cruzi DTUs的抗锥虫活性:1对Y株(TcII)和CL-Brener株(TcVI)的IC
50分别为0.31和0.29 μM,强于对Tulahuen株(TcVI,0.76 μM)的活性,证明其具有广谱抗不同DTU的能力。
讨论与结论:该研究表明,T. cruzi对结构修饰的耐受性低于L. infantum,苯甲酰胺上的2,4-二甲氧基是抗T. cruzi活性的药效团关键,但也是代谢不稳定的根源。虽然大多数衍生物效力下降,但化合物20、24和16分别代表了抗T. cruzi、抗L. infantum和ADME优化的互补模板。研究结论指出:本研究成功合成了25个化合物(含24个衍生物)并系统评价了其生物学活性;尽管未获得同时满足高活性(IC
50 < 1 μM)和最优ADME特性的候选化合物,但研究厘清了关键的结构优化方向,即组合1、20、24的高效活性特征与16的优异ADME特性,为未来合理设计真正的先导候选药物奠定了坚实基础。