跨物种功能转录组投射:巨噬细胞源性免疫代谢应激程序描绘腹主动脉瘤中谱系加权的免疫结构组织

《SN Comprehensive Clinical Medicine》:Cross-species Functional Transcriptomic Projection of a Macrophage-derived Immunometabolic Stress Program Maps Lineage-weighted Immune-structural Organization in Abdominal Aortic Aneurysm

【字体: 大 中 小 】 时间:2026年10月10日 来源:SN Comprehensive Clinical Medicine

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   摘要背景腹主动脉瘤(AAA)反映了相互作用的免疫、代谢和结构异常,但实验定义的应激程序向人类疾病的可转移性尚不确定。我们评估了一种源自九小时小鼠巨噬细胞模型的方向性程序,该模型结合了固有免疫刺激和半胱氨酸耗竭。由于RNA表达无法确立膜裂解,因此将源实验作为急性免疫代谢扰动锚点

摘要

背景

腹主动脉瘤(AAA)反映了相互作用的免疫、代谢和结构异常,但实验定义的应激程序向人类疾病的可转移性尚不确定。我们评估了一种源自九小时小鼠巨噬细胞模型的方向性程序,该模型结合了固有免疫刺激和半胱氨酸耗竭。由于RNA表达无法确立膜裂解,因此将源实验作为急性免疫代谢扰动锚点处理,而非线粒体氧化裂解执行证据。

方法

在小鼠-人类同源基因一对一映射之后,将一个冻结的533基因线粒体氧化裂解模型衍生转录评分(MPRS)投射到四个人类全转录组队列和两个单细胞RNA测序数据集中。预指定的全转录组对比使用Hedges g和全局Benjamini-Hochberg校正进行评估。来自八名经证实的AAA患者的患者水平伪全样本谱通过精确符号翻转推断进行分析,并进行评分修剪、应激残差化、组成代理和跨数据集敏感性分析。

结果

11个主要全转录组对比中无一通过全局校正。破裂与稳定对比在一个队列中名义上呈阳性(g = 0.784; P = 0.00806; FDR = 0.0887),但仍属探索性。患者水平分析将广泛的源衍生程序相对定位到单核细胞/巨噬细胞(效应 = 0.281; 精确FDR = 0.0234),并远离成纤维细胞(效应 = -0.155; FDR = 0.0234),在两个单细胞数据集和留一患者分析中方向一致。HLA-II/干扰素活性扩展到B细胞和内皮区室,而结构稳态信号定位在成纤维细胞和血管平滑肌细胞区室。AAA与两个非动脉瘤对照组之间的广泛细胞类型层次高度一致(Spearman rho = 0.943),表明存在相当大的基线谱系成分。

结论

跨物种功能转录组投影未能识别出普遍适用的AAA标志物或确立线粒体氧化裂解执行。但它仍然将巨噬细胞优先确定为直接验证模型衍生免疫代谢应激程序的最相关细胞环境,并解析了在整体组织中模糊的谱系加权免疫-结构组织。需要更大规模的病例对照、空间、生化和扰动研究。

临床试验注册

本研究不是涉及患者招募或干预性治疗的临床试验,因此临床试验注册不适用,也无临床试验注册编号可用。

背景

腹主动脉瘤(AAA)反映了相互作用的免疫、代谢和结构异常,但实验定义的应激程序向人类疾病的可转移性尚不确定。我们评估了一种源自九小时小鼠巨噬细胞模型的方向性程序,该模型结合了固有免疫刺激和半胱氨酸耗竭。由于RNA表达无法确立膜裂解,因此将源实验作为急性免疫代谢扰动锚点处理,而非线粒体氧化裂解执行证据。

方法

在小鼠-人类同源基因一对一映射之后,将一个冻结的533基因线粒体氧化裂解模型衍生转录评分(MPRS)投射到四个人类全转录组队列和两个单细胞RNA测序数据集中。预指定的全转录组对比使用Hedges g和全局Benjamini-Hochberg校正进行评估。来自八名经证实的AAA患者的患者水平伪全样本谱通过精确符号翻转推断进行分析,并进行评分修剪、应激残差化、组成代理和跨数据集敏感性分析。

结果

11个主要全转录组对比中无一通过全局校正。破裂与稳定对比在一个队列中名义上呈阳性(g = 0.784; P = 0.00806; FDR = 0.0887),但仍属探索性。患者水平分析将广泛的源衍生程序相对定位到单核细胞/巨噬细胞(效应 = 0.281; 精确FDR = 0.0234),并远离成纤维细胞(效应 = -0.155; FDR = 0.0234),在两个单细胞数据集和留一患者分析中方向一致。HLA-II/干扰素活性扩展到B细胞和内皮区室,而结构稳态信号定位在成纤维细胞和血管平滑肌细胞区室。AAA与两个非动脉瘤对照组之间的广泛细胞类型层次高度一致(Spearman rho = 0.943),表明存在相当大的基线谱系成分。

结论

跨物种功能转录组投影未能识别出普遍适用的AAA标志物或确立线粒体氧化裂解执行。但它仍然将巨噬细胞优先确定为直接验证模型衍生免疫代谢应激程序的最相关细胞环境,并解析了在整体组织中模糊的谱系加权免疫-结构组织。需要更大规模的病例对照、空间、生化和扰动研究。

临床试验注册

本研究不是涉及患者招募或干预性治疗的临床试验,因此临床试验注册不适用,也无临床试验注册编号可用。

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