基于回顾性全基因组测序的哈萨克斯坦沙门氏菌遗传与表观遗传多样性研究

摘要

salmonella enterica 是全球食源性和侵袭性感染的主要致病菌。本研究采用全基因组测序技术，比较了保存在档案库中的细菌菌株的基因型，并对其基因组多样性进行了分析。这些菌株主要来源于临床和兽医样本，来自哈萨克斯坦。共22株细菌通过Illumina全基因组测序进行了分析，结果确认其中20株为 salmonella enterica，2株为 salmonella enterica 菌株使用PacBio Revio SMRT技术进行了DNA甲基化谱型分析。研究内容包括基因组组装、质粒重建、MLST基因分型以及毒力基因、抗菌素耐药性决定因子、限制性修饰（R-M）操纵子和孤儿甲基转移酶的分析。比较基因组分析显示该菌株集合中存在显著的基因型多样性，而系统发育分类结果与MLST分类一致。ST11是最常见的基因型，占所有20株

摘要

订阅生物通快讯

最新文章

限时促销

会展信息

关注订阅号/掌握最新资讯