基于脐带血DNA甲基化数据构建产前空气污染暴露预测模型的验证与优化研究

《Environmental Epigenetics》:A methodology to identify a DNA methylation-based signature of prenatal air pollution exposure in the ECHO Cohort

【字体: 大 中 小 】 时间:2026年10月10日 来源:Environmental Epigenetics 4.3

编辑推荐:

   摘要 在不同人群中,产前暴露于环境空气污染物与儿童不良健康结局之间存在关联。在缺乏直接的空气污染暴露测量数据的情况下,表观遗传生物标志物可作为累积暴露的指标。此前,我们开发了一套方法学流程,用于构建预测模型,以识别

摘要

在不同人群中,产前暴露于环境空气污染物与儿童不良健康结局之间存在关联。在缺乏直接的空气污染暴露测量数据的情况下,表观遗传生物标志物可作为累积暴露的指标。此前,我们开发了一套方法学流程,用于构建预测模型,以识别子宫内高暴露于空气污染物的婴儿,该模型基于脐带血样本中的DNA甲基化数据。在此,我们使用来自环境因素影响儿童健康结果(ECHO)队列中多个孕产队列站点的数据来检验并完善该流程。利用地理编码地址数据和机器学习方法,对产前细颗粒物(PM2.5)、二氧化氮(NO2)及8小时最大臭氧(O3)暴露水平进行了建模。DNA甲基化通过450K或EPIC芯片进行测定。基于暴露水平、队列站点和芯片类型创建并匹配了训练集和验证集,利用曲线下面积(AUC)指标检验流程预测模型的性能。在三种暴露物中,基于表观遗传预测的PM2.5和NO2产生的AUC值(分别为0.64–0.68和0.62–0.95)高于O3(0.50–0.75)。我们发现了该流程模型在不同地理区域、暴露窗口以及用于区分"高"和"低"空气污染物暴露的阈值方面性能的差异。总体而言,该流程能够从DNA甲基化数据中估算空气污染水平,但需谨慎考虑模型输入参数。后续研究将检验该流程所识别的CpG位点在预测儿童健康结局方面的性能。

注释

合作伙伴完整名单请参见补充材料1

订阅生物通快讯

订阅快讯:

最新文章

限时促销

会展信息

关注订阅号/掌握最新资讯

今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

版权所有 生物通

Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

联系信箱:

粤ICP备09063491号