基于DECCODE方法的药物重定位策略鉴定促进棕色脂肪组织产热激活的小分子

《Biology Direct》：Data-driven identification of small molecules inducing brown adipocyte activation and differentiation

摘要

背景

促进人类棕色脂肪组织（BAT）的募集和功能在预防和治疗肥胖及相关代谢并发症方面具有重要意义。尽管鉴定能够增强BAT募集和产热激活的基因至关重要，但传统的上调方法往往效率低下。然而，小分子可以通过安全、快速的机制促进这一过程。

方法

在我们的研究中，我们采用了基于差异表达的药物增强细胞转化（DECCODE）方法，这是一种无偏见的药物诱导转录组学方法，以鉴定促进细胞转化的小分子。我们首先建立了人多能干细胞（PSC）来源的BAT细胞的转录组谱作为目标，然后评估了整合网络细胞特征库（LINCS）中的小分子与该目标的相似性，从而确定候选池。

结果

在人体产热脂肪细胞中的实验验证表明，两种已获批用于其他适应症的药物——沙格列汀和托伐普坦——显著增强了产热激活。

结论

我们的方法提供了一种实用且资源高效的方式，来鉴定具有再利用潜力的小分子。虽然彻底的实验验证仍然至关重要，但这一计算机模拟框架具有灵活性，可广泛应用于各种细胞谱系。

图形摘要