饶河河流域景德镇段水体DNA检测鱼类群落的两次调查比较

《Biology》：Environmental DNA Metabarcoding Reveals Spatiotemporal Variation in Fish Communities of the Middle Raohe River, China

　　

简要摘要

可靠的鱼类多样性信息对于指导河流监测至关重要，但传统的捕捞调查可能会遗漏某些物种。我们分析了饶河河流域景德镇段十个采样点在两次调查期间水体中鱼类DNA的痕迹。总体而言，我们检测到了100个鱼类分类单元。两次调查之间的局部多样性指标未发现显著差异，但DNA检测的组成有所不同。三个河流组之间的差异在2023年比2024年更为明显。这些结果为受调查的站点提供了分子基线数据，并展示了水体DNA分析如何补充传统的鱼类调查。

摘要

环境DNA（eDNA）代谢条形码技术可以为河网中的鱼类群落提供物种名录。我们于2023年10月20日至23日及2024年6月2日至5日，对饶河河流域景德镇段东河、昌河和乐安河的十个站点进行了调查。每个站点和每次调查将三个技术流程重复样本合并，共产生20份群落分析图谱。两次调查分别检测到96个和94个分类单元，总共100个鱼类分类单元，其中90个为共有种。配对调查之间的丰富度、Shannon多样性、Simpson多样性和Pielou均匀度均未出现显著差异。两次调查之间的群落组成存在显著差异（Bray–Curtis PERMANOVA：R² = 0.293；Jaccard：R² = 0.185；两者校正后p = 0.002）。PERMDISP未检测到色散不均。河流组间的分化在2023年更为明显，而2024年在多重检验校正后两种距离指标均不显著。一个考虑了站点和调查效应的简化环境偏RDA分析结果不显著（F = 0.971，p = 0.420）。这些发现为十个受调查站点提供了两次调查的分子物种名录，并识别了调查间的组成差异，但未证明季节动态或独立的环境驱动因素的存在。