益生菌干预促进幽门螺杆菌根除疗法后胃肠道菌群跨区室生态恢复

《Gut Pathogens》：Probiotics modulate the interactions between gastric and intestinal microbiota after Helicobacter pylori eradication

　　

摘要

背景

幽门螺杆菌（H. pylori）的标准根除疗法会引发显著的重症胃肠道菌群失调。本研究探讨了益生菌补充是否能缓解这些空间性微生物扰动，并促进根除后的生态恢复。

材料与方法

将C57BL/6小鼠分为五组：未感染对照组、H. pylori PMSS1感染组、接受两周三联疗法（奥美拉唑、克拉霉素和甲硝唑）的感染组，以及根除后进行四周自发恢复或益生菌补充（Enterococcus faecium R0026和Bacillus subtilis R0179）的感染组。通过配对胃部和粪便16 S rRNA测序评估微生物组成、跨区室共存网络及预测功能谱。

结果

H. pylori感染重塑了胃部和肠道菌群，其中胃部扰动更为显著。然而，根除疗法引发了严重的区室特异性菌群失调，主要表现为肠道菌群紊乱，以变形菌门近乎完全耗竭以及Escherichia-Shigella和Klebsiella的扩增为特征。根除后四周的自发恢复仍不完全。有趣的是，益生菌给药显著加速了胃肠道恢复，并优先重塑肠道菌群。它补充了耗竭的胃部优势菌属，如Pseudomonas、norank_f_Muribaculaceae和Ligilactobacillus，并通过富集变形菌门和短链脂肪酸（SCFA）产生菌（包括Lachnospiraceae_FCS020_group和Ligilactobacillus）来恢复肠道菌群。配对分析显示，根除严重破坏了胃和肠之间共享的ASVs，而这种跨区室连通性被益生菌有效恢复。值得注意的是，这种微生物恢复伴随着跨区室网络稳定性的增强、预测的SCFA代谢和免疫调节通路的富集以及肠道屏障完整性的改善。

结论

我们阐明了H. pylori感染和根除疗法所驱动的截然不同的空间生态扰动。益生菌干预主动协调了胃肠道微生物组的协同恢复，为这种辅助策略对抗根除引起的菌群失调提供了有力的临床前证据。