2023–2025年伊朗流感A(H1N1)pdm09病毒全基因组测序：基因组变异、抗原漂移与疫苗效力评估

《Virology Journal》：Molecular evolution and epitope landscape of influenza A(H1N1) viruses in Iran: insights from whole-genome sequencing (2023–2025)

## 摘要### 背景流感病毒不断进化，导致遗传多样性增加，从而促进流感疫情和大流行。高突变率增加了免疫逃逸的概率，因此降低了疫苗的有效性。本研究旨在调查2023–2025年流感A/H1N1病毒的基因组和分子变化。### 方法本研究采用Oxford Nanopore技术，对伊朗2023–2024和2024–2025季节流行的30个流感A(H1N1)pdm09毒株进行了全基因组测序（WGS）。随后进行了基因组、分子和系统发育分析，并使用表位方法估计了疫苗效力。### 结果流感A/H1N1病毒的全基因组测序显示，2024–2025季节流行的毒株与疫苗株的相似度（98.78%）略低于2023–2024季节流行的毒株（99.13%）。表位A是两个季节中最多样的区域，2023–2025年期间针对主导表位的估计疫苗效力在38.1%至50.5%之间。在内部蛋白中识别出多个替换位点，其中与毒力相关的NS1蛋白I123V替换在疫苗株和受分析毒株中均被检测到。此外，受研究毒株对神经氨酸酶抑制剂仍主要保持敏感性，尽管有一个毒株携带S247N替换。系统发育分析显示，90%的伊朗毒株聚集在6B.1 A.5a.2a分支内，该分支包括同一季节全球流行的病毒。尽管系统发育树之间存在拓扑结构差异，但未检测到重配现象。### 结论伊朗在2023–2024和2024–2025流感季节流行的A(H1N1)pdm09病毒的表位景观显示，其遗传组成因HA和NA的抗原漂移而发生季节性变化。尽管存在这些变化，流行毒株仍与相应的疫苗株密切相关，且针对替换位点最多的表位的估计疫苗效力是可接受的，这与世卫组织建议保留A/Wisconsin/67/2022作为2025–2026季节疫苗的建议一致。本研究强调了在全球框架内进行国家流感监测的重要性，以监测抗原变化、评估大流行风险、指导疫苗毒株选择以及评估抗病毒耐药性。