常州小型城市河流水体与沉积物微生物群落特征及功能潜力的季节性差异研究

《BMC Microbiology》：Microbial community and potential functions in small urban river of Changzhou, China

　　

摘要

背景

城市河流接收大量的有机物和营养物，这些物质塑造了微生物群落及其相关的生物地球化学过程。然而，对于小型城市河流而言，配对的水体和沉积物栖息地中细菌和真菌群落及其潜在功能的研究仍然有限。

方法

本研究在12月和8月从常州的四条小型城市河流中采集了水样和沉积物样品，利用16S rRNA基因、ITS扩增子测序和宏基因组分析来表征微生物组成及其功能潜力。

结果

结果表明，栖息地类型和季节性的环境过滤共同塑造了细菌和真菌的多样性及群落结构。与碳、氮和磷循环相关的基因在8月表现出较高的基于TPM的相对丰度模式，而与环境适应功能相关的基因在12月表现出较高的相对丰度模式。一种潜在的新型候选MAGs含有与砷转化、N?O还原和碳水化合物利用相关的基因。

结论

总之，本研究突出了环境条件和水-沉积物栖息地异质性在构建小型城市河流微生物组中的交互作用，为了解人类干扰河流生态系统中元素循环的微生物功能提供了见解。