EML4–ALK 融合重构非小细胞肺癌中转录组、miRNA 及 CAF 相关程序

《Clinical and Translational Oncology》：EML4–ALK fusion rewires transcriptomic, miRNA, and CAF-associated programs in non-small cell lung cancer

# 摘要## 目的本研究通过对配对的 mRNA/miRNA 表达和肿瘤微环境特征进行整合分析，以描绘非小细胞肺癌（NSCLC）中与 EML4-ALK 融合状态相关的分子图谱。## 方法利用源自 TCGA 的融合阳性和融合阴性 NSCLC 队列，我们比较了肿瘤生物学的三个互补层面：转录组结构、miRNA-mRNA 调控网络和免疫 - 基质组成。## 结果融合阳性肿瘤表现出独特的分子程序，其特征是代谢和蛋白质稳态重编程，包括与内质网蛋白加工和输出相关的糖酵解和 N-聚糖生物合成途径。与融合阴性肿瘤相比，它们还显示出基质浸润减少以及细胞外基质、粘附、钙信号和细胞因子相关转录程序的减弱。整合 miRNA 分析鉴定出一个与融合相关的、以 miR-3065 为中心的调控枢纽，其预测靶点与细胞外基质和粘附相关，包括 PDGFRB、CTSK、COL4A2、SPARC、FBN1 和 LUM；而融合阴性肿瘤则显示出与增殖和纤毛程序相关的 miRNA 网络改变。肿瘤微环境分析进一步区分了这两组，融合阳性肿瘤显示出癌症相关成纤维细胞浸润减少。## 结论这些发现描绘了与 EML4-ALK 融合阳性 NSCLC 相关的独特分子和微环境特征，并鉴定出候选调控网络和生物标志物，待验证后，这些信息可为亚型特异性治疗分层提供参考。## 图形摘要