《Journal of the American Heart Association》:Machine‐Learning Prediction of Tumor Comorbidity and Cancer‐Associated Mortality in Patients With Coronary Heart Disease: A 2‐Stage Modeling Study
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背景:冠心病(coronary heart disease, CHD)合并肿瘤的患病率日益上升,且与更高的死亡率相关。研究人员旨在开发2个预测模型,以实现对CHD患者肿瘤风险及CHD合并癌症患者死亡风险的早期识别。方法:研究人员分析了2001至2023年间在华
背景:冠心病(coronary heart disease, CHD)合并肿瘤的患病率日益上升,且与更高的死亡率相关。研究人员旨在开发2个预测模型,以实现对CHD患者肿瘤风险及CHD合并癌症患者死亡风险的早期识别。方法:研究人员分析了2001至2023年间在华中科技大学同济医学院附属同济医院就诊的134 141例CHD患者,并采用北京大学第一医院(中国北京)收集的数据进行外部验证。研究人员开发并评估了6种机器学习(machine learning, ML)模型,包括极端梯度提升(extreme gradient boosting, XGBoost)、轻量梯度提升机(light gradient boosting machine, LGBM)、随机森林、神经网络、决策树和逻辑回归。通过Shapley加性解释(Shapley additive explanation, SHAP)提升了模型的可解释性,并随后部署了在线预测平台。结果:在预测CHD患者肿瘤风险的模型中,XGBoost在测试集中表现最佳(受试者工作特征曲线下面积[area under the receiver operating characteristic curve, AUROC]=0.935),并取得了最低的Brier评分(0.080),其灵敏度、准确率和F1评分分别为0.740、0.882和0.751。同时,LGBM在测试集中的院内死亡预测中表现良好(AUROC=0.965),取得了最低的Brier评分(0.019),以及最高的灵敏度(0.677)和F1评分(0.599)。两个模型在外部验证中也表现出良好的性能,提示具有一定程度的泛化能力。结论:研究人员构建了2个预测模型,用于评估CHD患者的肿瘤风险及癌症相关死亡风险。该网络平台可辅助临床医生的决策制定和患者管理。
论文解读
一、研究背景与目的
冠心病(coronary heart disease, CHD)与癌症是全球范围内导致发病和死亡的两大主要原因,两者之间存在多种共同风险因素。2021年全球CHD患病人数超过2.5亿,相关死亡人数达899万;2022年全球癌症新发病例1873万,死亡病例967万。临床上CHD合并肿瘤的患者日益常见,一项前瞻性研究表明6.5%的急性冠脉综合征患者合并癌症,另一项英国人群队列研究显示30.3%的癌症患者存在既往心血管疾病。CHD与癌症共存时,住院死亡率显著升高。然而,现有研究多聚焦于特定类型癌症患者的心血管事件风险预测,且多为样本量不足5000的单中心研究,模型稳定性与泛化能力受限。由于癌症类型多样、影响因素复杂,目前缺乏针对CHD患者肿瘤共病风险及CHD合并癌症患者死亡风险的有效预测工具。基于此,研究人员利用机器学习(machine learning, ML)方法开发了两阶段预测模型:第一阶段预测CHD患者的肿瘤发生风险,第二阶段评估CHD合并癌症患者的院内死亡风险,并构建在线预测平台以辅助临床决策。
二、研究内容与结论
研究人员回顾性收集了2001年至2023年同济医院三个院区共134 141例CHD住院患者的数据,外部验证数据来自北京大学第一医院(第一阶段n=2040,第二阶段n=1005)。经特征筛选后,第一阶段纳入82 490例患者(肿瘤发生率为16.8%),第二阶段纳入10 846例CHD合并癌症患者(院内死亡346例)。研究比较了6种ML算法(XGBoost、LGBM、随机森林、神经网络、决策树、逻辑回归),最终确定XGBoost为第一阶段最优模型,LGBM为第二阶段最优模型。在测试集中,两模型AUROC分别达到0.935和0.965,外部验证AUROC分别为0.719和0.727,显示出良好的泛化能力。基于最优模型,研究团队部署了在线预测平台,可按输入变量计算个体化风险,并据此将患者划分为低、中、高风险等级。
三、主要技术方法
研究采用的主要技术方法包括:(1)6种机器学习算法建模与5折交叉验证超参数优化;(2)分层两阶段特征选择策略,先以受试者工作特征曲线下面积(AUROC)、Cramér's V统计量及Cohen's D效应量进行单变量相关性评估,再结合递归特征消除与置换重要性进行多变量冗余消除;(3)Shapley加性解释(SHAP)进行模型可解释性分析;(4)校准曲线、决策曲线分析和精确率-召回率曲线评估模型可靠性及临床效用;(5)随机欠采样处理类别不平衡;(6)外部独立队列验证。数据处理方面,采用缩尾处理、自然对数转换及标签编码等方法。
四、研究结果
(一)模型1:预测CHD患者肿瘤风险
共纳入82 490例CHD患者,13 833例发生良性肿瘤或癌症(16.8%)。伴肿瘤患者年龄更大、女性比例更高,吸烟、饮酒及输血史更常见。经特征选择后确定13个预测变量:乙型肝炎e抗原、红细胞分布宽度-变异系数、红细胞沉降率、高密度脂蛋白胆固醇、血糖、乳酸脱氢酶、D-二聚体、高敏心肌肌钙蛋白I、体重、年龄、肌酐、N末端前脑钠肽及乙型肝炎e抗体。在6种ML模型比较中,XGBoost表现最优,AUROC=0.935,Brier评分最低(0.080),灵敏度0.740,特异度0.927,准确率0.882,F1评分0.751。SHAP分析显示乙型肝炎e抗原、红细胞分布宽度-变异系数、红细胞沉降率、D-二聚体、N末端前脑钠肽、肌酐和年龄与肿瘤风险正相关,而高密度脂蛋白胆固醇、血糖、乳酸脱氢酶、高敏心肌肌钙蛋白I及乙型肝炎e抗体呈负相关,体重呈U形关联。
(二)模型2:预测CHD合并癌症患者院内死亡率
共纳入10 846例CHD合并癌症患者,院内死亡346例。死亡组患者年龄更大、男性比例更高,脉搏更快而血压更低。经特征选择确定7个预测变量:估算肾小球滤过率、体重、高敏C反应蛋白、N末端前脑钠肽、γ-谷氨酰转移酶、脉搏和年龄。LGBM为最优模型,AUROC=0.965,Brier评分0.019,灵敏度0.677,特异度0.980,准确率0.970,F1评分0.599。SHAP分析显示体重、高敏C反应蛋白、N末端前脑钠肽、γ-谷氨酰转移酶、脉搏和年龄与死亡风险正相关,估算肾小球滤过率呈U形关联。
(三)外部验证
采用北京大学第一医院独立队列进行外部验证,第一阶段2040例,第二阶段1005例(8例死亡)。虽多数变量的基线特征与训练集存在统计学差异,但模型仍表现出满意的预测性能,AUROC分别为0.719和0.727,提示模型具有一定程度的泛化能力。
(四)模型应用
研究团队将最优算法及全部关键预测变量整合至在线预测平台。输入各变量数值并选择模型后,平台可计算肿瘤和癌症相关死亡风险,以相对风险(预测概率与研究人群平均预测概率之比)划分低风险(<1.0)、中风险(1.0~2.0)和高风险(≥2.0)三个等级,辅助临床医生进行风险分层和患者管理。
五、讨论与结论
讨论部分指出,CHD与癌症可能共享炎症等共同病理生理机制。第一阶段的乙型肝炎病毒相关标志物阳性与肿瘤风险升高相符;体重与肿瘤呈复杂U形关联,肥胖增加多种癌症风险,而体重下降也可能预示癌症发生;红细胞分布宽度-变异系数和红细胞沉降率反映炎症负荷,高密度脂蛋白胆固醇具有保护作用,D-二聚体升高与癌症患者高血栓风险相关。第二阶段中,年龄、肥胖、高脉搏、高敏C反应蛋白、N末端前脑钠肽及γ-谷氨酰转移酶升高均与死亡风险增加相关,估算肾小球滤过率呈U形关联可能反映癌症相关肌肉丢失对肌酐生成的影响。由于缺乏癌症分期、病理亚型和抗肿瘤治疗详细信息,研究人员无法确定这些预测因子反映的是特定的心脏-肿瘤相互作用还是晚期疾病的总体严重程度。结论表明,研究人员开发的两个预测模型性能良好,可实现对肿瘤风险和癌症相关死亡的早期预警,在线平台有助于临床医生进行患者管理和及时调整治疗方案。