《Protist》：Integrating free-living amoebae into climate-microbiome and One Health frameworks
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气候变化正在全球尺度上改变微生物生态系统，但自由生活阿米巴（free-living amoebae, FLA）在这些变化中的微生物组（microbiomes）中的作用仍未被充分理解。FLA分布于土壤、水、空气和建成环境中，参与微生物多样性、调节营养循环，并作为
气候变化正在全球尺度上改变微生物生态系统，但自由生活阿米巴（free-living amoebae, FLA）在这些变化中的微生物组（microbiomes）中的作用仍未被充分理解。FLA分布于土壤、水、空气和建成环境中，参与微生物多样性、调节营养循环，并作为多种细菌、真菌和病毒微生物的宿主。随着温度、湿度和土地利用格局改变，阿米巴行为及其相关微生物组可能以影响土壤肥力、水质、微生物网络稳定性以及机会致病菌（opportunistic pathogens）持续存在的方式发生变化。通过摄食，阿米巴调节细菌周转和微生物生物量中矿质营养的释放，在营养循环与支撑土壤肥力的植物可利用养分库之间提供机制联系。理解这些动态对于全球微生物组（planetary microbiome）研究和加强连接环境、动物与人类健康的一体化健康（One Health）方法至关重要。在本综述中，研究人员在气候变化、全球微生物组和One Health背景下讨论FLA，并考虑其生态作用如何与微生物系统的更广泛变化相关。研究人员综合当前将FLA与气候响应性微生物组动态联系起来的证据，并提出将其作为响应性生态指标纳入全球微生物组和One Health框架。将阿米巴整合进监测、生态建模和气候适应策略，可能提高追踪气候驱动微生物变化的预测能力。
研究人员围绕气候变化如何重塑微生物生态系统以及FLA在其中的位置展开综述。背景是，全球变暖、降水、盐度、土壤湿度和紫外线辐射变化正在改变微生物群落；FLA广泛存在于土壤、水、空气和建成环境，参与微生物多样性、营养循环，并作为细菌、真菌和病毒宿主。大多数FLA无人类疾病关联，但Acanthamoeba spp.、Naegleria fowleri、Balamuthia mandrillaris等具临床相关性。细菌、病毒和真菌在气候变化研究中受较多关注，而FLA对气候驱动环境变化的响应及其对微生物生态系统和病原持续的影响仍认识不足；致病FLA也较少纳入标准监测。传统细菌或病毒指示物主要反映粪便污染或水质急性失败，FLA可整合摄食、囊化和胞内微生物联合体等信息，提供补充生态指示。作者由此开展综述与概念整合，综合证据并提出将FLA作为响应性生态指标纳入全球微生物组和One Health框架，结论是其整合进监测、生态建模和气候适应策略可提高对气候驱动微生物变化的预测能力，并连接环境、动物和人类健康。该综述作者为 Ruqaiyyah Siddiqui、Sutherland K. Maciver、David Lloyd 和 Naveed Ahmed Khan。
方法上，研究人员采用目标性同行评议文献检索与叙述性综述，组合自由生活阿米巴、气候变化、环境微生物学、微生物组、One Health、土壤与水生态、致病性、盐度、温度和环境胁迫等术语，纳入能提供阿米巴生态、环境响应、微生物互作或One Health/全球微生物组框架证据的原始研究、综述和概念论文，并优先关注 Acanthamoeba、Naegleria、Balamuthia 及相关FLA，同时以其他原生生物证据补充机制背景。该综述未涉及原始样本队列。其提出可行研究路径包括：横断面野外调查，将阿米巴丰度、囊（cyst）流行率和胞内微生物群与温度、湿度、土地利用梯度关联；实验室气候模拟系统，对代表性阿米巴进行受控升温或干燥，量化囊化、摄食和胞内微生物组变化；检测与监测可结合显微镜、PCR、定量PCR（qPCR）、纳米颗粒辅助PCR和宏基因组方法。
1. 引言：该部分通过概念梳理指出，FLA是生态多样的环境原生生物，在土壤、淡水、建成环境中参与摄食、营养循环和群落动态；多数与疾病无关，但若干类群具临床意义。作者定义“致病性”仅指已有人类疾病关联，不代表独特生态特征。然而FLA对气候驱动变化的响应、病原持续和抗菌耐药作用仍表征不足。
2. 文献检索与综述方法：该部分通过目标检索与证据选择，纳入相关原始研究、综述和概念论文，强调 Acanthamoeba、Naegleria、Balamuthia 及相关FLA。结论是，气候变量可能通过生物学合理机制影响阿米巴存活、囊化和毒力，但直接实证仍有限。
3. 自由生活阿米巴与生态系统：该部分通过综合土壤、根际、湿地、森林等研究指出，FLA是细菌的重要捕食者，可加速碳、氮、磷矿化，改变细菌群落并促进植物生长；其囊可抵抗干燥、紫外线辐射和消毒剂，保护胞内细菌，成为病原储库。原生生物驱动摄食还可增强凋落物分解和微生物碳通量，并受温度影响。
4. One Health与全球微生物组：该部分通过框架分析指出，土壤微生物组是One Health和全球微生物组的基础，FLA作为捕食者、宿主和储库桥接环境与宿主微生物组。全球变化可能重塑FLA及其相关微生物组，增加病原暴露并扰动微生物平衡，但FLA仍多缺席于One Health模型。
5. 气候变化与微生物组：该部分通过综合生理与实验证据指出，温度影响 Acanthamoeba 脂肪酸代谢和膜组成，进而影响分裂、摄氧、吞噬和膜流动性；盐度实验中34 g/L海盐明显抑制 Naegleria fowleri 和 Acanthamoeba griffini 滋养体生长。气候压力可能选择耐捕食、耐胁迫且更适合人类感染的微生物；但长期生态响应因物种和区域而异，直接证据有限。
6. 面向One Health和全球微生物组研究的建议：该部分通过提出监测与研究框架，建议将 Acanthamoeba spp.、Naegleria fowleri、Balamuthia mandrillaris 纳入土壤和水监测，结合显微、PCR/qPCR、纳米颗粒辅助PCR和宏基因组，建立基线并分阶段实施，跨部门合作纳入生态模型和风险评价；农业施肥和石灰调节pH等是额外压力。
7. 结论性意见：该部分通过总结指出，FLA位于气候敏感微生物网络中心，应纳入气候-微生物组研究、One Health和全球微生物组框架，并可作为追踪微生物对气候变化响应的潜在实践指标系统。
讨论部分强调，FLA的广泛分布、微生物调节和胞内宿主双重角色，使其成为理解气候驱动微生物变化的重要窗口；应把其纳入监测、预测模型和气候适应策略，以增强早期检测和风险识别，同时需考虑实验室能力、标准化、培训、采样频率和成本，宜从气候敏感或高风险环境开始分阶段实施。
研究结论部分翻译：气候变化正在以仅被部分理解的方式改变微生物生态系统，而自由生活阿米巴是这一图景中关键但长期被忽视的组成部分。它们在土壤、水和空气中的广泛存在，以及作为微生物调节者和多样胞内生物宿主的双重角色，使其处于气候敏感微生物网络的中心。随着环境条件改变，阿米巴的行为、分布和微生物关联可能随之变化，并对营养循环、土壤和水质、微生物群落结构以及机会致病菌的持续存在产生影响。这些动态强调需要将阿米巴纳入气候-微生物组研究，在那里它们可提供机制性洞见，说明微观相互作用如何扩展并影响更广泛的生态韧性。在One Health和全球微生物组框架内承认自由生活阿米巴，将有助于弥合环境科学、微生物生态学和公共卫生之间的差距。它们对温度、湿度和土地利用压力的响应提供了一个有价值的视角，用以解释环境不稳定性并预判下游生物学后果。将阿米巴整合进监测计划、预测模型和气候适应策略，将增强对变暖世界中微生物变化的理解，并提高识别新发风险的能力。随着行星系统持续被人为压力重塑，承认阿米巴的生态意义将有助于以更完整和更具韧性的方式保护环境、动物和人类健康。研究人员提出，将自由生活阿米巴纳入全球微生物组和One Health模型可提供一个新视角，作为追踪微生物对气候变化响应的潜在实践指标系统。
