马铃薯木栓质分析的整体方法:从降解产物到木栓质沉积再到伤口周皮代谢物分析的时间回溯

《Phytochemistry》:A Holistic Approach to Potato Suberin Analysis: A Time Travel from Breakdown Products to Suberin Deposition to Metabolite Profiling of Wound Periderm

【字体: 大 中 小 】 时间:2026年10月13日 来源:Phytochemistry 3.4

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   •协同的自下而上和自上而下的分析揭示了伤口亚油素的新分子视图•随着伤口愈合的进行,二羧酸和羟基脂肪酸相对增加•随着愈合的进行,单羧酸脂肪酸的百分比组成减少•脂肪酸酚盐和阿烷基酚盐的甘油酯在愈合期间相对减少•解聚产物包括显著的糖生物碱、甾醇和酚胺类引言在马铃薯块茎的栽培、收获、

  
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    协同的自下而上和自上而下的分析揭示了伤口亚油素的新分子视图
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    随着伤口愈合的进行,二羧酸和羟基脂肪酸相对增加
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    随着愈合的进行,单羧酸脂肪酸的百分比组成减少
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    脂肪酸酚盐和阿烷基酚盐的甘油酯在愈合期间相对减少
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    解聚产物包括显著的糖生物碱、甾醇和酚胺类

引言

在马铃薯块茎的栽培、收获、分销和储存期间,作物面临着机械损伤、干燥和微生物侵入的重大风险 (Lulai, 2007)。在最近的一项调查中,我们比较了四种具有不同褐皮形态的土豆品种在伤口愈合过程不同阶段对损伤的时间抗性现象 (Dastmalchi et al., 2019)。我们观察到在初始闭合层形成前的三天内,特别是在伤口组织的极性提取物中,抗菌活性突然爆发。代谢物分析表明酚胺类和糖生物碱是赋予这些防御特性的主要化合物。特别是,酚胺类代谢物类别包括简单和复杂的酚胺和/或酰胺,而糖生物碱是甾体生物碱糖苷 (Dastmalchi et al., 2021; Dastmalchi et al., 2019; Ginzberg et al., 2009; Jin et al., 2018; Lulai and Neubauer, 2014; Lulai et al., 2015; Woolfson et al., 2022)。尽管如此,这些测量仅提供了解马铃薯块茎防御化学作用的部分信息,因为在愈合过程的后期阶段,块茎会形成一种由细胞壁嵌入的亚油素生物聚合物组成的疏水物理屏障,提供防止水分流失、热量流失和病原体攻击的保护 (Lulai, 2007; Lulai and Neubauer, 2014; Lulai et al., 2015)。
根据多种证据,提出了几种令人感兴趣的亚油素大分子结构和发育模型,以解释通过电子显微镜观察到的化学成分和特征层状结构 (Bernards, 2002; Gra?a and Santos, 2007; Kosma et al., 2025; Serra and Geldner, 2022; Woolfson et al., 2022):化学解聚产物的光谱表征 (Gra?a, 2015; Kolattukudy, 1980; Ranathunge et al., 2011);疏水性成分的组化染色 (Lulai and Morgan, 1992);完整的亚油素化细胞壁 (Bernards et al., 1995; Stark and Garbow, 1992; Yan and Stark, 2000);伤口愈合组织产生的代谢物 (Dastmalchi et al., 2014; Dastmalchi et al., 2015; Yang and Bernards, 2007),或拟议生物合成步骤的遗传和细胞生物学分析 (Lulai et al., 2015; Serra et al., 2010; Serra et al., 2009a; Serra et al., 2009b; Woolfson et al., 2018)。主流模型包括与相关酚类相关的脂肪族聚酯,或由共价连接的脂肪族和酚族域组成的聚合物 (Gra?a, 2015; Serra and Geldner, 2022; Woolfson et al., 2022)。历史上,许多提议的结构架构依赖于具有已知挑战的自上而下解聚处理:分解不完全、产量低,且信息仅限于适合通过 GC-MS 方法检测的小的可溶性分子片段 (Kolattukudy, 1984; Walton, 1990)。在分子水平上理解亚油素化现象的另一种自下而上的方法是监测伤口愈合不同阶段代谢物的形成,即利用 GC-MS 和/或 LC-MS 技术对一系列伤口后时间点的伤口周皮组织提取物进行代谢物分析 (Dastmalchi et al., 2014; Dastmalchi et al., 2015; Jin et al., 2018; Landgraf et al., 2014; Yang and Bernards, 2007)。在目前的方法中,我们使用 LC-MS 和 GC-MS 方法识别非极性化合物,这些化合物可能是纳入亚油素大分子结构的代谢中间体,从而获得伤口组织的全面非极性代谢物分析图谱。独立于这些自上而下或自下而上的测定,亚油素化细胞壁的聚合物组成已通过固态 13C 核共振 (ssNMR) 确定 (Bernards et al., 1995; Dastmalchi et al., 2015; Garbow et al., 1989; Jin et al., 2018; Round et al., 2000; Stark and Garbow, 1992; Yan and Stark, 2000)。尽管如此,超出聚合物复合材料中主要含碳化学基团识别的信息需要定量可靠的数据采集程序、含有稳定 NMR 活性同位素的样品 (Yan and Stark, 2000),和/或通过动态核极化技术进行信号增强 (Dastmalchi et al., 2025)。
鉴于单独应用这些方法所得到的马铃薯块茎防御的有用但有限的化学信息,我们通过协调研究代谢物、聚合物和解聚产生的产物,寻求改进的亚油素大分子结构测定途径。如上所述,这种策略的潜力显而易见,因为一些对伤口形成的反应性代谢物可以被纳入正在发育的保护性聚合物中。此外,一部分聚合物应该易于随后的解聚,从而可以回收可识别的可溶性产物。因此,当前的工作是一个单一研究的第一个实例,其中同时使用 LC-MS 和 GC-MS 来改进解聚产物的分析,提供更全面的化学分析图谱,并解决与每种分析技术相关的缺点。此外,我们首次纳入了一对自下而上和自上而下的调查方法,以鉴定伤口愈合期间形成的代谢物和相应的解聚化学成分。我们说明了这一调查方法,针对四种块茎显示褐皮特征梯度的马铃薯品种。同时,我们将可溶性分子物种的每组发现与从不溶性亚油素化细胞壁聚合物复合物的 13C ssNMR 光谱中获得的结构分析图谱进行关联,从而揭示伤口愈合马铃薯块茎中亚油素化背后的预期和意外化学成分。有了这些植物化学发现,我们为 newly identified 化学物质提出了结构和功能角色,并将其置于当前亚油素 - 细胞壁大分子复合物的模型背景下。

章节摘要

非极性提取物的 LC-MS 代谢物分析图谱与时间关系:所有品种在第 2 天后成分趋于一致

为了补充我们之前对显示强抗菌活性的极性周皮提取物中伤口诱导分子发育的测定 (Dastmalchi et al., 2019),我们开始使用 LC-MS 和每个品种的多变量统计分析对相应的非极性提取物混合物进行化学表征,重点关注其作为伤口后时间点函数的区分特征。选择 LC-MS(图 S1)来检查轻度非极性化合物,包括

讨论

为了将上述报告的大量化学发现融合成对亚油素大分子结构的连贯解释,我们首先考虑从组织提取物、固体聚合物复合材料和解聚产物中获得的主要化学类别和分子成分的相对数量。特别强调可能提供亚油素大分子结构线索的意外结构和趋势。通过考虑化合物之间的关系

结论

综上所述,对伤口愈合代谢物、解聚产物和固体亚油素化细胞壁成分的协调分析有助于加强关于马铃薯块茎周皮组织响应伤口而形成的植物聚合物化学结构的提案。此外,糖生物碱、甾醇和酚胺类成分的意外突出地位为我们对该必需植物材料的分子水平视图增添了新元素。最终结果是更加

实验部分

植物材料。David Holm 博士 (科罗拉多州立大学,科罗拉多州福林斯) 提供了 2015 年收获的 Norkotah Russet、Atlantic、Chipeta 和 Yukon Gold 马铃薯品种。
化学药品和试剂。LC-MS 级甲醇、乙腈和水购自 J. T. Baker;分析级氯仿和甲醇购自 Fisher Scientific;吡啶购自 EMD Millipore 公司;N-甲基 -N-(三甲基硅基) 三氟乙酰胺 (MSTFA) 购自 Thermo Scientific。
富亚油素分离

CRediT 作者贡献声明

Arina Kligman:方法论、调查、形式分析。Mathieu Perez:写作 – 审阅和编辑,写作 – 原稿,方法论、调查、形式分析、数据整理。Keyvan Dastmalchi:写作 – 审阅和编辑,写作 – 原稿,监督、方法论、调查、形式分析、数据整理、概念化。Ruth E. Stark:写作 – 审阅和编辑,写作 – 原稿,监督、资源、资金获取、形式分析、数据整理,

未引用参考文献

Deng et al., 2021; Dimbi et al., 1985; Tian et al., 2024.

数据和材料可用性

本手稿包含一份代表性补充数据的 EXCEL 数据表。其他基础数据已放在补充图表中。

利益冲突声明

? 作者声明他们没有已知的竞争财务利益或个人关系,这些利益或关系可能会影响本文报告的工作。

7. 致谢

作者感谢 David Holm 博士 (科罗拉多州立大学) 提供马铃薯块茎。我们感谢 Van Chanh Phan 博士和 Hsin Wang 博士在 ssNMR 测量方面的慷慨协助,以及 Lijia Yang 博士提供的 GC-MS 技术支持。本研究由美国国家科学基金会 (NSF MCB-1411984 资助 R.E.S.) 的拨款支持;M.P.R. 在该拨款支持下参加了本科生研究经历 (REU) 实习。此外,该工作由
Keyvan Dastmalchi|Mathieu Perez|Arina Kligman|Barney Yoo|Ruth E. Stark
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