实施基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱前后呼吸道标本中丝状真菌的物种分布及临床意义

《Journal of Infection and Chemotherapy》：Species distribution and clinical significance of filamentous fungi detected from respiratory specimens before and after matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry implementation

摘要

背景

常规临床实践中，从呼吸道标本中检测到的丝状真菌的临床意义尚不明确，尤其是对于非曲霉属真菌。我们评估了实施 MALDI-TOF MS 后的纵向菌种分布及临床相关性。

方法

这项单中心回顾性研究纳入了 2010 年至 2024 年间呼吸道标本丝状真菌阳性的 585 例患者；保留每位患者最近的阳性标本。比较了独立的实施前 (2010–2018) 和实施后 (2019–2024) 时期。回顾了 228 例实施后患者的病历。将菌株分类为曲霉属或非曲霉属丝状真菌。接受系统性抗真菌药物治疗的案例被归类为临床治疗感染，未治疗案例为定植。比较了两组之间的临床特征。

结果

总体而言，307 株 (52.5?%) 为曲霉属，130 株 (22.2?%) 鉴定为非曲霉属丝状真菌，148 株 (25.3?%) 未能鉴定。从实施前到实施后时期，已鉴定的非曲霉属丝状真菌从 17.6?% 增加到 29.4?% (p?=?0.001)，而未鉴定的菌株从 28.6?% 减少到 20.2?% (p?=?0.023)。在实施后队列中，58 名患者为临床治疗感染，170 名为定植。多变量分析显示，非曲霉属的检测与临床可治疗感染呈负相关 (OR 0.268, 95?% CI 0.121–0.565)，而皮质类固醇或其他免疫抑制剂的使用呈正相关 (OR 3.300, 95?% CI 1.597–6.974)。

结论

MALDI-TOF MS 的实施与未鉴定菌株减少以及非曲霉属丝状真菌识别率提高相关。当从呼吸道标本中检测到丝状真菌时，应结合真菌种类、宿主因素和临床表现来评估感染。

引言

从呼吸道标本中分离出的丝状真菌可能代表短暂污染、气道定植、过敏性疾病、慢性肺部感染或侵袭性真菌病。即使是曲霉属，仅呼吸道培养阳性特异性也有限；其临床意义取决于症状、结构性肺病、免疫状态、放射学发现以及互补的真菌学证据 [1]。这种不确定性对于非曲霉属丝状真菌更为显著，因为其缺乏特定于病原体的生物标志物和标准化的疾病定义 [2,3]。

尽管如此，非曲霉属丝状真菌在临床上仍有意义。由镰刀菌、赛多孢子菌、层叠孢子菌、暗色真菌、马尔尼菲菌属、紫色色孢霉属及相关属引起的罕见丝状真菌感染主要发生在免疫功能低下的宿主中，且难以治疗 [2,3]。相反，青霉属、裂褶菌及其他环境真菌的检测可能反映定植或变态反应性支气管肺真菌病，而非侵袭性疾病 [[4], [5], [6], [7]]。因此，将所有阳性培养结果归为感染可能会导致过度治疗，同时未能识别出临床相关的非侵袭性疾病。

丝状真菌的传统鉴定依赖于宏观和微观形态学，可能停留在属水平或无法解决。基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱 (MALDI-TOF MS) 可以提高鉴定速度和菌株鉴定比例，尽管性能取决于样本制备、光谱库和鉴定阈值 [8]。基于人群和特定疾病的研究表明，曲霉属通常占主导地位，但其他丝状真菌的分布因患者群体和实验室方法而异 [[9], [10], [11]]。在日本常规实践中，来自未选择呼吸道标本的纵向数据仍然有限。

因此，我们描述了 15 年间从呼吸道标本中检测到的丝状真菌的分布，比较了常规实施 MALDI-TOF MS 前后的独立时期，并检查了实施后队列中与临床治疗感染相关的临床因素。

章节摘要

研究设计与参与者

我们在日本浜松大学医院进行了一项回顾性观察研究。源人群包括 2010 年 1 月 1 日至 2024 年 12 月 31 日期间至少有一份呼吸道标本检测到丝状真菌的所有住院和门诊患者。在 981 份阳性标本中，同一患者的重复记录被简化为最近的阳性标本，得出 585 例患者。使用完整队列来描述菌种分布和标本

队列与标本特征

筛选每位患者最近的一份阳性标本后，队列包括 585 例患者。研究流程和解析队列如图 1 所示。标本包括 487 例患者 (83.2?%) 的痰液，94 例 (16.1?%) 的支气管冲洗液，以及 4 例 (0.7?%) 的肺组织。申请科室为 477 例患者 (81.5?%) 的呼吸科。274 例患者 (46.8?%) 的样本在门诊设置中采集，311 例 (53.2?%) 在住院期间采集。

MALDI-TOF MS 实施前后的菌种分布

在 585 株菌株中

讨论

在这个 15 年单中心队列中，从呼吸道标本中检测到的丝状真菌中，近一半未被常规实验室工作流程归类为曲霉属。独立日历时期的比较显示，常规实施 MALDI-TOF MS 与已鉴定的非曲霉属丝状真菌大幅增加以及未鉴定菌株减少相关，而曲霉属的比例没有显著变化。在实施后队列中，

作者贡献

Kazuki Furuhashi：概念化，方法学，形式分析，调查，数据管理，可视化，撰写 - 原稿，项目管理，资金获取。Osanori Nagura, Tatsuhiro Deshita, Saaya Nozue, Nachi Hirai, and Jinko Ishikawa：方法学，调查，资源，数据管理，验证，撰写审阅和编辑。Sho Takuma, Mineo Katsumata, Yusuke Inoue, Hideki Yasui, Hironao Hozumi, Masato Karayama, and Yuzo Suzuki：调查，验证，

数据可用性

本文章背后的数据将应合理要求与通讯作者共享。

资金支持

本研究由日本学术振兴会科学研究补助金 (26K11116, KF) 和日本医学研究开发机构变态反应与免疫学研究补助金 (25eK0410138, KF) 支持。

利益冲突

作者没有利益冲突需要声明。

致谢

我们要感谢 Editage (www.editage.jp) 提供的英语语言编辑服务。

Kazuki Furuhashi|Sho Takuma|Osanori Nagura|Tatsuhiro Deshita|Saaya Nozue|Nachi Hirai|Jinko Ishikawa|Mineo Katsumata|Yusuke Inoue|Hideki Yasui|Hironao Hozumi|Masato Karayama|Yuzo Suzuki|Keita Yamashita|Moriya Iwaizumi|Noriyuki Enomoto|Naoki Inui|Takafumi Suda|Tomoyuki Fujisawa

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