古寄生虫学(Palaeoparasitology):古代寄生虫研究的技术与方法范围及多来源证据整合

《Parasitology》:Palaeoparasitology: exploring the range of techniques and approaches used in the study of ancient parasites

【字体: 大 中 小 】 时间:2026年10月13日 来源:Parasitology 2.5

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  在本期关于古寄生虫学(palaeoparasitology)的特刊中,一系列值得注意的证据被汇集起来,以提高研究人员对过去人群(past populations)中寄生虫的理解。若干因素使该合集具有较强说服力。第一是广泛的地理分布,论文来自美洲(America

  
在本期关于古寄生虫学(palaeoparasitology)的特刊中,一系列值得注意的证据被汇集起来,以提高研究人员对过去人群(past populations)中寄生虫的理解。若干因素使该合集具有较强说服力。第一是广泛的地理分布,论文来自美洲(Americas)、欧洲(Europe)和亚洲(Asia)。所涵盖的时间尺度也非常全面,证据从早期史前时期(early prehistory)延伸至工业化时期(industrial period)。然而,可能构成其最大优势的因素是投稿研究人员为探索古代文明(ancient civilizations)中的寄生虫所应用的技术范围。通过探索哪些技术和方法最能回答不同类型的研究问题,研究人员可以发展出一种更平衡的方法来研究古代寄生虫。这应使研究人员能够获得关于寄生虫如何影响其祖先以及如何塑造历史进程的新见解。首先,研究人员将考虑可获得的证据来源,然后考虑可用于研究这些来源的方法。
古寄生虫学(palaeoparasitology)关注古代人群中的寄生虫。本期特刊汇集多种证据,以增进对过去人群寄生虫的理解。其优势包括地理覆盖广,涉及美洲、欧洲和亚洲;时间跨度大,从早期史前时期到工业化时期;以及投稿研究人员使用多种技术探索古代文明中的寄生虫。当前问题在于,显微镜长期是古代寄生虫研究默认技术,但不同研究问题可能需要不同证据来源和分析方法。开展该特刊/研究的目的在于探索哪些技术和方法最适合回答不同问题,从而发展更平衡的研究路径,获得关于寄生虫如何影响祖先、塑造历史进程的新见解。其重要意义在于,多证据整合可更全面理解人类和其他动物与寄生虫之间的长期密切关联。

为开展研究,主要关键技术方法包括:证据来源涉及粪便遗存、厕所和下水道、墓葬盆腔沉积物、粪化石(coprolites)、木乃伊肠道内容物、井沉积物、梳子、衣物、木乃伊和古地面沉积物,以及医学、农业和历史文本。分析方法包括光学显微镜(light microscopy)检测肠道蠕虫卵;古DNA(ancient DNA, aDNA)分析短片段;酶联免疫吸附测定(enzyme-linked immunosorbent assay, ELISA)检测抗原或囊肿;历史文本解读;地理制图和风险模型;流行病学(epidemiology)数据整合;综述整合。样本队列来源涉及美洲、欧洲、亚洲;黑海 Phanagoria;巴西约2000年墓葬;英国 Vindolanda;安纳托利亚/现代Turkiye;中世纪 Netherlands;韩国;中国等。

Sources of evidence(证据来源):最常见的材料是粪便遗存,可从中发现肠道寄生虫卵。来源包括厕所、下水道、墓葬盆腔沉积物、粪化石和木乃伊肠道内容物。其他有效来源包括井沉积物,用于判断供水是否清洁或污染;Slepchenko等研究黑海沿岸中世纪 Phanagoria 的井沉积物。梳子、衣物、木乃伊和古地面沉积物可用于体外寄生虫(ectoparasites)。书面来源可提供过去疾病、病因观念和治疗信息。Jones汇集欧洲中世纪医学文本,展示当时对肠道蠕虫的理解;Browning和Nicovich利用罗马和中世纪沼泽地区季节性发热描述,绘制Turkiye贸易路线疟疾风险;Li等查阅中国3000年前文本,识别与疟疾周期性发热相符的疾病描述;Chen等利用宋代(960–1279 CE)文本寻找肠道寄生虫和人粪施肥证据。

Methods for analysing these sources(分析这些来源的方法)

Microscopy(显微镜):光学显微镜适合检测肠道蠕虫卵,成本效益高,可提供图像。特刊论文用它鉴定 Ascaris sp.、Trichuris sp.、Dibothriocephalus sp.、Fasciola sp.、Spirometra sp.、Capillariids、Eimeria sp.、Acanthocephala、strongylids、Dioctophymidae 等。

Genetics(遗传学):古DNA在考古背景下以50–100碱基对短片段存活。若片段具物种特异性,可扩增证明过去人群存在该寄生虫。巴西2000年前墓葬盆腔沉积物古DNA分析鉴定出人类和其食用鱼类寄生虫。近期古代人类骨骼遗存疟疾遗传证据用于显示亚洲过去人群疟原虫种类,增强对东地中海和中国周期性发热文本解释疟疾的信心。

Enzyme-linked immunosorbent assay(酶联免疫吸附测定):ELISA利用抗体结合特定寄生虫蛋白,可检测繁殖期小而脆弱的原生动物,这些阶段常被土壤微生物破坏而难以镜检。特刊中用ELISA试剂盒检测英国北部哈德良长城附近 Vindolanda 罗马时期要塞的 Giardia duodenalis 囊肿。

Historical texts(历史文本):研究过去社会疾病的逻辑起点是阅读当时医生医学文本。Jones汇集欧洲中世纪手稿相关段落,描述作者所见寄生虫形状和大小,并说明中世纪对寄生虫成因和治疗选择。Chen等查阅1000年前中国农业文本了解人粪施肥;宋代城市文本显示供水与污水分离问题,生鱼、腌鱼和甲壳类流行增加感染风险。Li等识别中国3000年前文本中与疟疾相符的周期性发热,早期汉字“疟”为虎攻击人,显示疟疾被视为致命;人类环境改变可能解释疟疾逐渐广泛。

Geographic mapping(地理制图):知道某地区某时期有某种寄生虫后,可研究其常见程度及随地理、季节、环境变化。Browning和Nicovich研究古典古代和中世纪 Anatolia(现代Turkiye)疟疾,比较1900年代初数据、古环境(河流路径、沼泽位置)和地理变异,构建多层疟疾风险模型,显示热点位于低海拔沿海河流三角洲和沼泽,靠近 Mediterranean、Aegean和Black Sea。Schats利用慢性贫血可触发的骨骼指标 cribra orbitalia(眶顶筛孔样变,与慢性贫血相关的骨骼指标)比较中世纪 Netherlands 不同地区,与1900年代初蚊密度比较,发现变化匹配,蚊密度最高地区 cribra orbitalia 最普遍。

Epidemiology(流行病学):整合已发表文献形成更大数据集,进行统计分析。Speredakos等研究欧洲过去9000年人类鞭虫和蛔虫感染变化相关因素,发现人口密度和气候是解释寄生虫成功变异的最重要因素,蛔虫对温度变化耐受高于鞭虫。

Reviews(综述):整合所有证据可提供最完整和情境化理解。Hong等呈现韩国从新石器到工业化的肠道寄生虫和卫生基础设施证据,趋势显示人口密度、卫生、肥料使用和饮食偏好影响土源性蠕虫(soil-transmitted helminths)、中国肝吸虫、食源性吸虫和绦虫(cestodes)感染。Mitchell提供全球主要人类寄生虫起源和进化相互作用观点,使用现代和古代寄生虫遗传数据、ELISA等生物分子技术、考古和历史证据,显示人类过去10 000年改变环境影响内寄生虫和体外寄生虫感染及致病。Panagiotakopulu整合人类和其他哺乳动物体外寄生虫证据,考虑进化起源、随迁移传播和过去人群负担。

Conclusion(结论)部分总结并翻译:虽然显微镜一直是绝大多数已发表古代寄生虫研究的默认技术,但更多技术可揭示过去人群中寄生虫的存在和后果。遗传分析、ELISA检测抗原、历史文本、骨骼遗存中与贫血相关病变、地理制图和流行病学均有很大潜力,为古代文明寄生虫感染提供新见解。当结合这些多样方法的信息时,针对特定寄生虫类群、地理区域或时间段的综述将能最全面和情境化地理解人类和其他动物与寄生虫之间长期而密切的关联。
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