悬浮培养筛选胰腺癌细胞抗失巢凋亡模型及自噬与泛素相关转录程序的鉴定

《BMC Cancer》：Transcriptomic profiling reveals autophagy-associated programs and prognostic biomarkers in anoikis-resistant pancreatic cancer cells

摘要

胰腺导管腺癌（PDAC）以侵袭性转移进展和临床预后不良为特征。在转移扩散过程中，脱离的肿瘤细胞必须克服失巢凋亡——一种因丧失细胞外基质附着而诱导的细胞凋亡形式。尽管抗失巢凋亡能力被认为是转移的关键前提条件，但支撑胰腺癌细胞脱离后存活的适应性机制仍未被完全阐明。本研究通过对Capan-1和PSN-1细胞进行反复长期悬浮培养，建立了抗失巢凋亡（AR）胰腺癌细胞模型，并通过转录组学分析鉴定了PDAC中与抗失巢凋亡相关的保守分子程序。基因集富集分析（GSVA）结果显示，两种AR模型中均一致地富集了自噬相关通路，同时细胞周期相关通路受到抑制。差异表达和整合通路分析进一步鉴定出若干与自噬调控和细胞因子信号通路相关的核心基因。生存分析表明，UBC和ATG14的高表达与胰腺癌患者的不良预后相关。我们的研究结果提示，经悬浮筛选的胰腺癌细胞经历了协调一致的应激适应性转录重塑，其特征为自噬和泛素相关转录程序的富集。