内陆高盐与低盐潟湖沉积物真菌及原核生物群落多样性的宏条形码比较及分子标记选择效应分析

《Microbial Ecology》：Marker-Dependent Biases and Contrasting Fungal and Prokaryotic Community Patterns in Hypersaline and Oligohaline Lagoons

　　**摘要**内陆高盐潟湖是一种独特的微生物生境，但其真菌多样性至今仍未被充分表征，在欧洲尤为如此。我们利用ITS1和ITS2宏条形码测序对真菌、以及16S rRNA基因扩增子测序对原核生物，比较了西班牙西部唯一一处永久性深水高盐潟湖——萨拉达格兰德·德·希普拉纳潟湖，以及邻近的低盐潟湖——拉埃斯坦卡潟湖的沉积物真菌与原核生物群落。当合并ITS1和ITS2数据集时，真菌群落主要由子囊菌门、罗泽尔菌门和担子菌门占主导，而原核生物群落则主要由假单胞菌门、蓝细菌门、拟杆菌门和绿弯菌门组成。真菌群落的α多样性在两个潟湖之间无显著差异，尽管ITS2检测到的ASV数量显著高于ITS1（*p* = 0.016）。基于Bray–Curtis距离的PERMANOVA分析表明，真菌群落组成与潟湖身份和分子标记均显著相关，其中标记选择所解释的变异大于潟湖身份，且潟湖×标记之间存在显著的交互作用。以电导率作为盐度的替代指标，其对真菌群落变异的解释量有限且不显著；然而，其独立贡献无法与两个潟湖之间的其他环境差异分离。相比之下，原核生物群落在两个潟湖之间表现出分类学差异，但β多样性分离在统计上不显著，且潟湖内部变异较大。大量真菌ASV在分类学或功能上仍未被归类，表明这些沉积物中蕴藏着尚未充分表征的真菌多样性。总体而言，我们的结果表明真菌和原核生物群落在对比鲜明的潟湖环境中表现出不同的响应模式，并且ITS1和ITS2能够获取互补的真菌多样性视图，这强调了在解读基于宏条形码测序的生态格局时，需要考虑标记选择的必要性。