澳大利亚原住民糖尿病肾病风险的血液DNA甲基化候选特征发现研究

《Communications Medicine》：Blood DNA methylation profiling identifies candidate diabetic kidney disease risk signatures in the PROPHECY Aboriginal Diabetes Study

【字体：大中小】 时间：2026年10月15日 来源：Communications Medicine 7.4

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　　摘要背景糖尿病肾病是导致肾衰竭的主要原因之一，但风险的分子预测因子仍定义不清，尤其是在承受不成比例负担的澳大利亚原住民中尤为如此。我们的目的是在 PROPHECY 原住民糖尿病研究中，确定与改善全球肾脏病预后（KDIGO）风险类别相关的血液衍生候选 DNA 甲基化特征。方法我

摘要

背景

糖尿病肾病是导致肾衰竭的主要原因之一，但风险的分子预测因子仍定义不清，尤其是在承受不成比例负担的澳大利亚原住民中尤为如此。我们的目的是在 PROPHECY 原住民糖尿病研究中，确定与改善全球肾脏病预后（KDIGO）风险类别相关的血液衍生候选 DNA 甲基化特征。

方法

我们对 95 名分层为非糖尿病（n = 23）、低风险（n = 21）、中风险（n = 26）、高风险（n = 14）或极高风险（n = 11）参与者的血液衍生 DNA 应用了甲基化 CpG 结合域测序。使用纳入临床、白细胞标志物和 CpG 密度协变量的协变量调整模型评估差异 MBD 富集甲基化区域。使用名义发现阈值对候选区域进行优先排序，并利用注释、随机森林建模和人类足细胞实验进行探索。

结果

对于主要的糖尿病肾病风险对比，1,317 个区域达到了名义发现阈值 P < 0.001，但没有任何区域达到 FDR < 0.10。在 16 个预定义分析项（11 个配对/分组对比和 5 个单组项）中，22,392 个名义差异甲基化区域 (DMR) 条目满足 P < 0.001，对应 13,024 个唯一候选区域。探索性随机森林模型表明，甲基化特征可能提供超越临床协变量的判别信息，尽管估计值需要独立验证。足细胞分析提供了位点水平的功能背景，但未实现全基因组跨组织重复性验证。