纵向单细胞 RNA 测序揭示肺纤维化自发消退的细胞与分子动力学

《Scientific Reports》：Longitudinal single-cell RNA-seq profiling of lung cell phenotypes, signaling, and cross-talk during fibrosis resolution

肺损伤后纤维化的消退区别于持续性/进展性肺实质瘢痕，其特征是对异常细胞类型的及时清除、过量胶原的移除以及肺泡结构的再生。与已确立的肺纤维化消退相关且所必需的信号通路、细胞间相互作用及表型转变尚未得到充分阐明。为解决这一关键知识空白，我们对自发性消退纤维化期间获得的小鼠全肺消化物进行了纵向单细胞RNA测序。我们观察到与纤维化相关的巨噬细胞和分泌细胞外基质的Csmd1?成纤维细胞群体在纤维化高峰期出现，并在消退过程中部分清除。本研究还揭示，在自发性消退期间，免疫细胞、间充质细胞和上皮细胞中与组织修复和纤维化相关且已建立的通路发生了显著变化。除促纤维化驱动通路下降外，潜在的抗纤维化通路cAMP、HGF/MET和TWEAK在自发性消退期间的若干细胞类型中富集。CellChat分析被用于预测每条通路的细胞发送者与接受者，并表征其纵向变化。我们对自发性纤维化消退期间全肺细胞与分子动力学的表征，为识别可能用于治疗肺纤维化的内源性通路提供了基础。