束状肌病的全外显子组测序及NEB基因错义变异对蛋白质热力学稳定性影响的生物信息学分析

《Scientific Reports》：The analysis of genetic variants in nine patients with nemaline myopathy: implications for diagnosis and genetic counseling

摘要

束状肌病（NM）是一种罕见的遗传性肌病，由于已鉴定出多个相关基因，因此表现出显著的临床和遗传异质性。本研究回顾性分析了9例NM患者。我们对9个家庭进行了全外显子组测序（WES）检测，并进行了生物信息学分析。采用简正模式分析（NMA）评估NEB基因中的错义变异对雾状蛋白热力学稳定性的影响。WES结果显示，这9名患者在TPM3、NEB和ACTA1基因中共有17个变异。根据美国医学遗传学与基因组学学会（ACMG）发布的变异分类标准，约三分之二的变异被归类为致病性或可能致病性，其余变异则被归类为意义不明确。同时，我们对NEB基因错义变异的粗粒化网络元分析显示，与另外两个错义变异相比，c.9146T?>?G（p.Ile3049Ser）变异在蛋白质的热力学范围内表现出显著更高的熵值，这可能导致蛋白质不稳定。本研究为束状肌病的诊断、预后和遗传咨询提供了有价值的见解和方法。通过回顾这些病例，我们希望丰富现有的束状肌病知识库。