基于Unyvero多重PCR平台检测碳青霉烯酶及β-内酰胺酶基因与表型药敏试验在革兰阴性临床分离株中的基因型-表型一致性评估
《Antibiotics》:Concordance Between Multiplex-PCR Resistance-Gene Detection and MIC-Based Susceptibility in Gram-Negative Clinical Isolates from a Romanian Tertiary Hospital
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时间:2026年10月16日
来源:Antibiotics 4.6
摘要
背景/目的:对抗菌药物耐药性决定因子的快速分子检测有望在传统的抗菌药物敏感性试验结果可得之前优化抗菌治疗。然而,这些检测方法的临床应用价值取决于所检测到的耐药基因与表型敏感性之间的一致性。本研究旨在评估通过Unyvero多重PCR平台检测到的碳青霉烯酶和β-内酰胺酶基因与采用表型抗菌药物敏感性试验比较方法获得的最低抑菌浓度(MIC)敏感性谱在革兰阴性临床分离株中的基因型-表型一致性。方法:共分析来自罗马尼亚一家三级医院的住院患者的117株非重复革兰阴性临床分离株。使用Unyvero多重PCR系统鉴定了耐药决定因子,包括blaKPC、blaOXA-48、blaOXA-23、blaCTX-M、blaTEM,以及氨基糖苷类、氟喹诺酮类和磺胺类耐药标志物。采用VITEK?2自动化系统,按照EUCAST标准进行表型抗菌药物敏感性试验。使用灵敏度、特异度、阳性预测值(PPV)、阴性预测值(NPV)和Cohen's κ系数评估基因型-表型一致性。结果:总体而言,78.8%(78/99)的分离株被分类为非敏感。最常检测到的碳青霉烯酶基因为blaOXA-48(n = 12),其次是blaKPC(n = 9)和blaOXA-23(n = 3)。blaKPC在预测肠杆菌目细菌美罗培南耐药性方面灵敏度为100%,具有一致性中等(κ = 0.58),而blaOXA-23在鲍曼不动杆菌碳青霉烯耐药性中显示出完全的诊断性能(灵敏度和阳性预测值均为100%)。相反,所有blaOXA-48阳性的肠杆菌目细菌对碳青霉烯类药物表型敏感,表明基因型-表型一致性较差。同样,blaCTX-M、gyrA83/87和qnrA/B/S在预测相应表型耐药性方面诊断性能有限。结论:表型-基因型一致性因耐药决定因子和革兰阴性细菌种类而异。检测到blaKPC和blaOXA-23可能有助于早期优化抗菌治疗,而blaOXA-48应与传统的表型抗菌药物敏感性试验结果结合解读。将快速分子诊断与表型敏感性试验相结合可能改善抗菌药物管理,优化多重耐药革兰阴性菌感染的治疗。
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