综述：染色质重置不完全的病理生理学后果：PHF20作为急性应激后允许性染色质状态的候选稳定因子

《Cell Communication and Signaling》：Incomplete chromatin resetting in chronic injury: PHF20 as a candidate stabilizer of persistent transcriptional states

　　

摘要

本综述探讨了染色质重置不完全所带来的病理生理学后果。急性组织应激会激活一系列转录程序，这些程序本应在初始刺激消退后被沉默；然而，在慢性损伤中，细胞可能无法完全重置这些状态，从而留下残留的允许性特征，维持转录能力。我们将植物同源域指蛋白20（PHF20）——一种甲基赖氨酸读取蛋白——作为此类状态的候选稳定因子加以讨论。我们有意在有限的意义上使用"稳定"一词：指的是保留再激活能力，并保护允许性位点免于完全抑制，而非维持持续的转录。这一区分至关重要，因为含PHF20的组装体本身并不具有激活功能——宿主细胞因子1（HCFC1）是非特异性致死（NSL）复合物的一种组成性亚基，同时也参与抑制性组装体——因此，PHF20更适合被置于分级转录调控的框架中，而非二元的活性-抑制模型中。

支持性证据并不均衡，我们在全文中明确加以区分。直接数据已确证以下结论：PHD指识别H3K4二甲基化，且这种识别有助于染色质富集；Tudor 2结构域可读取二甲基化p53和二甲基化雌激素受体α；PHF20与PHF20L1定义了组成不同的NSL复合物；Phf20基因敲除小鼠在围生期致死，且未出现H4K16乙酰化的全局性丧失。对已发表占有率数据的重新分析表明，PHF20的绑定高度集中于启动子近端区域，而PHF20L1仅出现在少数PHF20结合位点，这为两种读取蛋白之间的冗余性给出了定量界限。相比之下，尚无研究探讨刺激撤除后PHF20的占有率变化，且各研究报告的染色质参与情况在结构域和标志方面均存在差异。

肾纤维化目前仍是唯一将PHF20与慢性损伤表型联系起来的体内场景，而现有模型并未检验刺激移除后表型的持续性。衰老和细胞衰老则提供了一个更广泛的背景，在此背景下，染色质解析缺陷可能促进行性组织功能障碍。由于没有证据表明PHF20能通过DNA复制得以保留，我们将该模型限定于非分裂或生长停滞的细胞。最后，我们提出了五项可证伪的预测以及用于验证这些预测的实验。