基于非培养方法评估季节、农场及清洗对乳牛乳头皮肤微生物群与梭菌数量的影响

《Animal Microbiome》：Teat skin microbiota of dairy cows: a study of seasonal-, farm-, and cleaning-related differences with emphasis on Clostridium spp.

　　生奶的品质和微生物组成对奶酪品质有着至关重要的影响。确保高质量的生奶并尽量减少细菌污染，需要保持足够的乳头皮肤卫生。乳牛的乳头皮肤微生物群高度多样化，尤其是存在形成芽孢的梭菌属细菌，这是奶酪生产者主要关注的问题，因为这些细菌主要引起硬质和半硬质奶酪的迟发酵缺陷。本研究旨在通过非培养方法评估季节、农场和清洗相关因素对乳头皮肤微生物群和梭菌数量的差异影响，并讨论其对生奶品质的潜在相关性。共调查了奥地利8家乳牛场382头奶牛的192份乳头皮肤拭子样本，分别在夏季、冬季和春季常规清洗前后，通过16S rRNA基因扩增子测序和定量PCR进行分析。季节差异和农场管理的不同显著影响了微生物群的多样性和梭菌属细菌的存在。清洗前后的细菌多样性无显著差异。然而，乳头清洗使梭菌pta基因拷贝数平均减少了83.3%。对酪丁梭菌的这种非培养定量方法与培养依赖结果呈强相关性，尽管培养依赖分析获得的平均计数更高。进一步的关联分析揭示了其他细菌属，如不动杆菌属和法克氏菌属，与酪丁梭菌的共存现象。本研究对奥地利乳牛的乳头皮肤微生物群进行了全面分析，揭示了农场、季节和清洗方法之间的显著差异。