Rubia cordifolia 内参基因在不同组织及非生物胁迫条件下的表达稳定性评估

《BMC Genomics》：Screening and validation of suitable internal reference genes for gene expression analysis in Rubia cordifolia L. under different abiotic stresses

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摘要

背景

Rubia cordifolia L是一种常用于临床实践的传统中药。随着对
R. cordifolia研究的深入，确定稳定的内参基因对于基因表达研究变得至关重要。全面的文献检索显示，无论是国内还是国际上都尚未有关于
R. cordifolia内参基因筛选的报道。本研究采用定量实时PCR（RT-qPCR）技术评估了几种候选内参基因在
R. cordifolia中的表达稳定性。鉴定出能在不同组织及多种应激条件下稳定表达的内参基因，为该植物的基因表达研究奠定了重要基础。

结果

本研究使用四种算法（geNorm、NormFinder、BestKeeper、ΔCt）分析了12种候选参考基因在
R. cordifolia不同组织及多种非生物胁迫（NaCl、脱水、SA、MeJA、ABA）条件下的表达稳定性。分析结果表明
hnRNP、UBQ、HIS3.3、PP2A和
PTBP2是稳定性最高的基因，而
ACT7和
EF-1α的稳定性最低。集成这四种算法的RefFinder确认
hnRNP、HIS3.3、PTBP2、PP2A和
RPL5为最稳定的前五位基因。通过目标基因
MVK的验证进一步证实了这些参考基因的可靠性。

结论

本研究系统地评估了
R. cordifolia内参基因的表达稳定性，这是进行该物种可靠功能基因组学研究的基础步骤。这些发现为准确阐明其基因的功能奠定了基础。

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