《Mathematical Biosciences》:Parkinson’s disease, Gaucher disease, and bistability in the lysosomal degradation pathway
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鞘脂(sphingolipids)是细胞膜的内在组分,其被转运至溶酶体(lysosomes)降解为神经酰胺(ceramide),后者在高尔基体(Golgi)中用于合成新的鞘脂。尽管鞘脂代谢非常复杂,但降解通路相对简单,可将鞘脂转化为神经酰胺和鞘氨醇(sphin
鞘脂(sphingolipids)是细胞膜的内在组分,其被转运至溶酶体(lysosomes)降解为神经酰胺(ceramide),后者在高尔基体(Golgi)中用于合成新的鞘脂。尽管鞘脂代谢非常复杂,但降解通路相对简单,可将鞘脂转化为神经酰胺和鞘氨醇(sphingosine)。该通路中酶基因的多态性与多种溶酶体贮积症(lysosomal storage disorders, LSDs)相关,其中一种酶,葡萄糖脑苷脂酶(glucosylceramidase, GCase1),与帕金森病(Parkinson’s disease, PD)、路易体痴呆(Lewy-body dementia, LBD)以及戈谢病(Gaucher disease)相关。研究人员构建了鞘脂降解通路的数学模型,并表明在GCase1的Vmax值较大范围内,该通路表现出双稳态(bi-stability),即两个稳态且二者之间存在滞后(hysteresis)。此外,已知由单体(monomers)和寡聚体(oligomers)形成突触核蛋白纤维(synuclein fibrils)的过程受降解通路影响,并反过来抑制GCase1。研究人员表明存在两个稳态,一个具有低纤维生成,一个具有高纤维生成,并伴有滞后。存在两个稳态且具有滞后这一事实,为药物发现和给药既带来挑战也带来机会。研究人员的工作对衰老(aging)具有意义,因为已知GCase1基因的表达水平随年龄下降。
论文解读:
研究背景:鞘脂(sphingolipids)是细胞膜内在组分,参与膜通透性、细胞信号和膜流动性调控。鞘脂在内质网和高尔基体(Golgi)由神经酰胺(ceramide)合成,转运至细胞膜,再进入溶酶体(lysosomes)和内质网降解回神经酰胺。溶酶体降解通路中,exo-α-sialidase(SIAL)、beta-galactosidase(GLB2)、glucosylceramidase(GCase1)和acid ceramidase(ACR)依次将鞘脂转化为神经酰胺和鞘氨醇(sphingosine),再循环至内质网和高尔基体。该通路酶缺陷或基因多态性与多种溶酶体贮积症相关,如SIAL与神经退行性疾病、GLB2与Tay-Sachs、GCase1与Gaucher disease、ACR与Farber disease。GCase1基因GBA1涉及帕金森病(Parkinson’s disease, PD)和路易体痴呆(dementia with Lewy bodies, DLB),患者血液GBA1 mRNA降低;GCase1活性随年龄下降,可能解释PD多为晚发。小鼠证据提示衰老导致的鞘脂代谢扰动,包括GCase1降低,可能加速PD病理过程。PD特征是黑质致密部(substantia nigra pars compacta, SNc)多巴胺能神经元退化,线粒体氧化应激和溶酶体功能障碍与神经元退化和Parkinsonism相关。GBA1突变是Parkinsonism主要遗传风险因素,也导致Gaucher disease,使GCase1底物GluCer积累并升高血浆GluSph。临床已描述Gaucher disease与PD联系,但机制不清。α-synuclein积聚形成Lewy bodies。Mazzulli et al.提出高GluCer激活α-synuclein组装,组装体反过来抑制GCase1,构成“双向致病环路”。因此,研究人员构建数学模型,以探究该降解通路中GCase1抑制是否导致双稳态和滞后,并评估其对药物设计、给药和衰老的意义。
关键技术方法:研究人员建立溶酶体鞘脂降解通路的常微分方程质量平衡模型;变量为底物浓度(μM),多数酶采用Michaelis-Menten动力学,K
m取自文献,V
max按底物浓度与测量范围一致来选取;GCase1速度含GluSph抑制项和synuclein寡聚体抑制项,ACR2速度对GluCer呈S型,synuclein速度含GluCer刺激项;线性速率常数作为复杂转运与代谢过程的占位。模拟通过改变GCase1 V
max、GM3输入和Cer输入,并随机扰动除GCase1外所有酶V
max 1000次检验稳健性。实验数据采用Dekker et al.和Rolfs et al.中Gaucher患者与健康对照的GluCer、GluSph数据重绘分析。
研究结果:
3. Inhibition of GCase1 by glucosylsphingosine:通过关闭红色相互作用、开启GluSph对GCase1的绿色抑制,模拟标准GM3和Cer输入均为50 μM/hr。结果在GCase1 V
max约100至450 μM/hr范围内,GluCer和GluSph均有两个稳态和滞后;V
max低于100 μM/hr仅高稳态,高于450 μM/hr仅低稳态。降低输入至40 μM/hr,双稳态区域左移并缩小至约68至255 μM/hr;降低至20 μM/hr,高稳态消失,仅低稳态。随机扰动其他酶V
max 1000次仍见双稳态和滞后。Dekker et al.和Rolfs et al.数据中Gaucher患者与对照的GluSph/GluCer呈分离簇,支持两个分离稳态。
4. Synuclein:通过关闭绿色抑制、开启红色相互作用,模拟标准输入。结果在GCase1 V
max约177至280 μM/hr范围内,GluCer和synuclein fibrils均有两个稳态和滞后;高V
max仅低稳态,低V
max仅高稳态。输入升高时转变点右移且双稳态区域增大;输入降低时区域减小;在90、100、110 μM/hr输入下均存在高、低稳态及二者共存的V
max范围。极低输入时仅一个正常稳态。双稳态和滞后在独立同时变化所有V
max参数时稳健。
讨论部分总结:鞘脂代谢难研究,涉及复杂生化及高尔基体、细胞膜、内体、内质网和溶酶体间转运。研究人员聚焦降解通路,展示两种GCase1抑制均可导致双稳态和滞后。酶K
m来自文献,V
max代表基因表达水平且随时间与个体变异大,其他参数为估计,因此双稳态发生的GCase1 V
max范围系统依赖。同时包含红、绿箭头也产生双稳态;ACR2 V
max变化亦可产生双稳态。Gaucher disease自1882年已知,患者表型广泛;1965、1966年发现其均存在GCase1有害变异。非神经元型Gaucher disease常表现为器官肿大、血细胞减少和骨病,GBA1突变使巨噬细胞积累GluCer等糖脂并形成“Gaucher cells”,浸润器官引起器官肿大、炎症等。神经元型Gaucher disease可出现脑干功能障碍、肝脾肿大和双侧第6神经麻痹等,GluCer在溶酶体异常积累导致内质网钙释放过多。PD与Gaucher disease联系较新:Sidranski于2005年提示GBA1突变与synucleinopathy可能存在临床联系,Mazzulli et al.提出机制;现认为GBA1多态性是PD主要风险因素。高GluCer刺激synuclein单体向寡聚体转化,寡聚体抑制GCase1使GluCer进一步升高,最终形成synuclein纤维;纤维具神经毒性,与SNc多巴胺神经元死亡相关。因此低GluCer稳态称“正常”,高GluCer稳态称“疾病”。双稳态在代谢模型中较少见,Ha、Satin和Sherman的糖尿病葡萄糖-胰岛素动力学模型存在稳定“健康”和“病理”稳态,糖酵解通量开关也是双稳态与滞后例子。正反馈可产生不稳定、双稳态和滞后。药物挑战与机会:若健康人处于低稳态,V
max降至200仍可稳定,低于177才切换至病理稳态;一旦进入病理稳态,药物需将V
max升至280以上方可使病理稳态消失并恢复。低Cer输入时仅正常稳态,提示抑制ceramide合成可能有用;联合限制ceramide输入和增加GCase1 V
max可能有益。GCase1活性随年龄下降,PD和DLB患者血液GBA1 mRNA降低,老年患者可能需持续药物保持GCase1 V
max高。若GCase1 V
max下降与SNc神经元死亡相关,提高GBA1表达和/或GCase1活性的药物可能改善或延缓PD,也可能对痴呆如此。
研究结论翻译:最近发现GCase1活性随年龄下降,使这一情形更加复杂和有趣,因为GCase1 V
max低值可能并非突然的特发性下降,而是衰老导致的下降。血液GBA1 mRNA在PD患者和Lewy-body dementia患者中降低,这使老年患者很可能需要持续药物治疗以维持GCase1 V
max处于高水平。PD的近端原因是SNc多巴胺神经元死亡。如果GCase1 V
max下降与SNc神经元死亡相关,那么通过药物提高GBA1表达水平和/或GCase1活性水平,可能改善或至少延缓PD,且对痴呆也可能如此。