肿瘤体细胞突变检测在识别以色列创始者致病突变携带者中的应用及预测价值

《npj Genomic Medicine》：Tumor analysis identifies Israeli founder pathogenic variation carriers

　　

摘要

以色列人群携带着12个基因中的53个已知创始者致病突变，这些突变存在于不同种族中，会增加癌症风险。目前，以色列癌症患者中创始者致病突变检测的诊断检出率为2%。在以色列癌症患者中，常规进行体细胞突变谱分析，以检测原癌基因和抑癌基因中的突变。为了更好地理解将体细胞突变检测重新用于识别已知以色列创始者致病突变携带者的效用，我们检查了以色列创始者致病突变在肿瘤中的检出程度。通过比较美国（n = 674,849）和以色列（n = 2,769）进行体细胞突变检测的肿瘤队列，我们发现分别有1%和6%的样本携带以色列创始者突变。我们检测了69例肿瘤中携带创始者致病突变的患者，发现体细胞检测结果与胚系检测结果的一致性高达99%。这些发现表明，在来自相应创始者族群的患者肿瘤中检测到创始者致病突变，对判断其携带者状态具有很高的预测价值。在可能的情况下，一旦在先证者中确认了胚系突变，可能需要对有风险亲属进行级联筛查。