黄尾脂鲤（Astyanax lacustris）的高质量染色体水平基因组组装

《Scientific Data》：The chromosome-level genome assembly of the Neotropical yellow-tailed tetra fish Astyanax lacustris (Teleostei: Characiformes)

　　

摘要

Astyanax 属是脂鲤目鱼类中多样性最高的属之一，在新热带界淡水生态系统中发挥着重要作用。然而，该属的高质量基因组资源仍然稀缺，大多数现有研究都集中在模式物种 Astyanax mexicanus 上。在此，我们提供了黄尾脂鲤 Astyanax lacustris 的高质量染色体水平基因组组装，这是一种在巴西巴拉那河上游流域分布广泛且具有重要生态意义的物种。最终组装跨度为 1.31 Gb，支架 N50 值为 49 Mb，98.8% 的序列被锚定到 25 个染色体大小的支架中，这与预期的单倍体染色体数相符。针对 actinopterygii_odb12 数据集，99.1% 完整的 BUSCO 支持了组装的完整性。该参考基因组为未来新热带界鱼类的比较基因组学、进化研究和保护遗传学提供了宝贵的基石。