非靶向代谢组学在免疫检查点阻断应答研究中的应用挑战与展望

《Scientific Reports》：Untargeted metabolomics in microbiome-immune crosstalk in cancer: challenges and recommendations for functional interpretation

　　

摘要

肠道微生物组通过影响宿主免疫在调节免疫检查点阻断（ICB）应答中发挥着关键作用。尽管已有若干研究鉴定出与ICB疗效相关的个别细菌物种，但研究结果仍不一致，其潜在机制也尚不明确。由于微生物代谢能力在不同个体间的保守性优于分类学组成，且与ICB应答相关，因此越来越多的研究关注肠道来源代谢物在ICB应答中的作用。非靶向代谢组学为以无偏倚方式研究这一领域提供了机会，但也面临重要的技术和解读挑战。本研究利用接受ICB治疗的错配修复缺陷/微卫星不稳定高度（MMR-d/MSI-H）转移性癌症患者的非靶向粪便代谢组学数据，探讨了代谢物注释与鉴定中的挑战、定义可靠的应答关联以及验证其潜在免疫调节作用。基于这些数据，我们概述了关键经验与推荐意见，以指导未来将代谢组学分析与微生物组-免疫动态联系起来的研究。