静水压诱导三倍体大黄鱼的转录组响应及其阶段性、组织依赖性分析

《Scientific Reports》：Transcriptomic insights into hydrostatic-pressure-induced triploidy in large yellow croaker (Larimichthys crocea) across developmental stages

　　

摘要

诱导三倍体被用于水产养殖中生产功能性不育种群，并可能改变资源在生长、维持和繁殖之间的分配。然而，与大黄鱼（Larimichthys crocea）中静水压诱导和三倍体相关的分子反应尚缺乏充分表征。在本研究中，被分配至诱导组的受精卵在受精后2分30秒时接受7000 PSI静水压处理3分钟。倍性分析证实压力诱导组为三倍体，对照组为二倍体。对5日龄幼鱼的全体重型和8月龄鱼的背鳍组织进行了RNA测序，每种处理组和采样背景均设3个生物学重复。在幼鱼中共检测到1,194个差异表达基因（DEGs），其中三倍体中859个基因上调、335个基因下调；在8月龄鱼中鉴定出3,174个DEGs，其中1,497个基因上调、1,677个基因下调。幼鱼DEGs富集于细胞-细胞黏附、上皮极性、紧密连接、蛋白质消化与吸收以及先天免疫相关通路。幼鱼蛋白质-蛋白质相互作用网络突出了紧密连接蛋白（claudin）家族基因和消化蛋白酶，大多数枢纽基因在三倍体中表达更高，但CLDN15和CLDN18表现出相反的模式。在8月龄鱼中，DEGs主要涉及核糖体生物发生、rRNA加工、剪接体、RNA降解、线粒体翻译、谷胱甘肽代谢以及氨基酸和类固醇代谢。涉及核糖核蛋白组装和线粒体核糖体的枢纽基因在三倍体背鳍中持续偏低。这些发现揭示了三倍体引起的发展阶段和组织背景依赖性的转录组反应，并为后续验证三倍体大黄鱼的上皮、翻译、代谢和免疫表型确定了候选分子模块。