放牧冈巴羊瘤胃细菌与真菌微生物组的组成及年龄相关特征

《Scientific Reports》：The dynamic changes of rumen bacterial and fungal microbiota in free-ranged Gangba plateau sheep

　　

摘要

冈巴羊是西藏高原的一个重要绵羊品种；然而，关于其瘤胃微生物组的信息甚少。本研究揭示了放牧冈巴羊瘤胃细菌和真菌微生物组的组成与特征。为进行细菌和真菌微生物组测序，从四个年龄组（6、18、30和42月龄；每组n=6）的放牧冈巴羊中采集了瘤胃液样本。冈巴羊中过滤后的细菌和真菌reads数量分别为2,421,684和2,463,063（bp）。不同年龄组冈巴羊的细菌和真菌α多样性指数未见显著差异。冈巴羊各年龄组中，优势细菌门为Bacteroidota（拟杆菌门）和Firmicutes A（厚壁菌门A），而Ascomycota（子囊菌门）和Basidiomycota（担子菌门）为优势真菌门。共有七个细菌门和三十九个属，包括UBA1711、Treponema D、CAG 41、CAJPSE01、Ruminococcus D和Denitrobacterium，在冈巴羊中表现出显著的年龄相关差异。此外，五个真菌属——Paraphaeosphaeria、Trichocladium、Dictyosporiaceae gen. incertae sedis、Entyloma和Coprinopsis——在不同年龄组间表现出显著变异。本研究为瘤胃微生物组提供了新的见解，强调了影响微生物生态的年龄相关变化。未来研究可探索这些微生物的功能角色及环境相互作用，以促进高原地区绵羊的健康和生产性能。