巴西儿科患者中马拉维多瘤病毒的基因组多样性、病毒重组与潜在分化谱系分析

《Nature Communications》：Genetic diversity and low-level infection of Malawi polyomavirus in pediatric patients in Brazil

　　

摘要

马拉维多瘤病毒（MWPyV）已在呼吸道和胃肠道样本中被检测到，主要见于儿童；然而，关于其分布和多样性的数据有限。在此，我们采用整合分子、系统发育和超微结构的方法，对来自巴西圣保罗州儿科患者的233份咽拭子样本进行了MWPyV及其潜在共感染的分析。我们在18份样本（7.7%）中检测到MWPyV DNA，病毒载量较低（平均266拷贝/反应；范围13-2.3 × 10³）。我们的系统发育分析将6个基因组序列归为基因型I，1个归为基因型III。基因型III的基因组显示出与基因型II和III相关的假设重组事件的证据。一个基因型I序列形成独特的系统发育分支，提示存在未采样或过渡性谱系。我们的研究结果提供了MWPyV在儿科患者中基因组多样性、病毒重组和潜在分化谱系的证据。