《Biology》:Effects of Nepeta cataria and Lactuca sativa on Microbial Community Structure and Nitrogen–Phosphorus Biogeochemical Cycling in Aquaculture Water
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尽管诊断和治疗取得重大进展,乳腺恶性肿瘤(breast malignancy)仍导致相当高的发病率和死亡率。顺铂(cisplatin)已在部分晚期乳腺癌患者中显示治疗活性,但其临床使用可能受到治疗耐药限制。尽管ARMCX3(Armadillo Repeat-C
尽管诊断和治疗取得重大进展,乳腺恶性肿瘤(breast malignancy)仍导致相当高的发病率和死亡率。顺铂(cisplatin)已在部分晚期乳腺癌患者中显示治疗活性,但其临床使用可能受到治疗耐药限制。尽管ARMCX3(Armadillo Repeat-Containing X-Linked Protein 3)在其他癌症中已有涉及,其在乳腺癌中的作用及潜在机制仍不清楚。研究人员利用缺失和回补实验研究ARMCX3功能,ARMCX3缺失降低体外(in vitro)细胞生长、迁移和侵袭并增加顺铂敏感性,而重新表达可挽救这些表型。转录组分析显示ARMCX3缺失后p53通路富集。PFT-α(p53转录活性抑制剂)处理抑制p53蛋白水平,并减弱ARMCX3敲低对细胞增殖、迁移、侵袭、细胞周期阻滞和顺铂反应的影响。ARMCX3敲低还与DNA损伤反应(DNA damage response)信号改变、顺铂诱导凋亡增强及体内(in vivo)肿瘤生长受抑相关,且所有这些效应均被PFT-α处理减弱。这些发现提示p53相关信号参与ARMCX3缺失对乳腺癌进展和顺铂反应性的影响。这些结果可能有助于为探索顺铂反应背景下ARMCX3相关信号的研究提供信息。
乳腺癌仍是造成全球女性癌症相关死亡的重要原因,2022年估计近230万新诊断病例和约67万死亡病例。尽管手术、内分泌治疗、靶向治疗和免疫治疗取得进展,化疗仍是晚期或转移性乳腺癌治疗的必需组成部分。顺铂(cisplatin)通过形成DNA交联、诱导DNA损伤和激活凋亡相关通路发挥抗肿瘤作用,在部分乳腺癌亚型尤其三阴性乳腺癌中显示活性,但获得性耐药限制其临床疗效。DNA损伤反应(DNA damage response, DDR)和凋亡信号失调参与铂类耐药,但其分子机制尚未完全明确。ARMCX3(Armadillo Repeat-Containing X-Linked Protein 3,含犰狳重复序列的X连锁蛋白3)主要定位于线粒体外膜,参与线粒体运输、动力学和细胞稳态;在肝细胞癌中上调并促进肿瘤细胞增殖和迁移,但其在乳腺癌和顺铂反应中的作用仍不清楚。p53(肿瘤蛋白p53)是协调细胞周期阻滞、DNA修复、凋亡和基因毒应激反应的核心肿瘤抑制因子。因此,研究人员旨在确定ARMCX3是否通过这些信号网络影响乳腺癌进展和细胞对顺铂的反应。研究人员利用公开数据评估ARMCX3表达及其与临床结局的关系,建立ARMCX3敲低乳腺癌细胞模型,并通过shRNA抗性ARMCX3构建体进行回补实验。随后进行RNA测序(RNA sequencing, RNA-seq)以表征ARMCX3缺失相关转录改变并识别潜在信号通路,基于转录组发现进一步检测p53相关信号、细胞周期调控、凋亡和DNA损伤反应信号,并进行异种移植实验评估体内肿瘤生长。研究结论提示,ARMCX3缺失抑制乳腺癌恶性表型并增强顺铂敏感性,p53相关信号参与其中。这些发现为ARMCX3在乳腺癌中的生物学功能提供新见解,并支持进一步研究其与顺铂反应性的潜在相关性。
主要关键技术与方法:利用TCGA–GTEx乳腺癌RNA-seq、CPTAC经UALCAN和HPA数据评估表达与生存;人乳腺癌细胞MCF-7和MDA-MB-231购自中国科学院细胞库;采用慢病毒shRNA敲低和shRNA抗性ARMCX3回补;RNA-seq数据GSE308702结合DESeq2、GO/KEGG、GSEA和STRING/Cytoscape分析;进行CCK-8、Transwell、流式细胞周期和Annexin V-PE/7-AAD凋亡、彗星实验、Western blotting;使用BALB/c nude小鼠异种移植、H&E和IHC。
3.1 ARMCX3在乳腺癌中显著上调并与较差总生存相关:TCGA–GTEx显示肿瘤中ARMCX3 mRNA高于非恶性乳腺组织;CPTAC蛋白数据经UALCAN显示乳腺癌标本中增加;HPA免疫组化显示乳腺癌组织蛋白表达高于正常;Kaplan–Meier分析显示高ARMCX3表达与较差总生存相关。
3.2 ARMCX3敲低抑制乳腺癌细胞增殖、迁移和侵袭并增强体外顺铂敏感性:研究人员建立稳定敲低MCF-7和MDA-MB-231细胞,Western blotting和RNA-seq确认ARMCX3降低;shRNA抗性ARMCX3回补恢复表达。CCK-8显示敲低降低增殖,Transwell显示降低迁移和侵袭,梯度顺铂处理显示细胞活力下降更大;回补部分恢复这些表型。
3.3 转录组分析揭示ARMCX3敲低与p53相关信号改变相关:RNA-seq显示MCF-7中3446个差异表达基因,其中2276上调、1170下调;MDA-MB-231中1568个,587上调、981下调。GO和KEGG富集及GSEA均显示p53信号级联显著改变;CDKN1A、FAS、TP53I3、RPRM、PHLDA3、AIFM2和DDB2等p53靶基因表达增加,CDKN1A转录显著增加。Western blotting显示ARMCX3敲低增加p53蛋白丰度,回补逆转。
3.4 PFT-α处理减弱ARMCX3敲低后的表型和p53相关变化:CCK-8和Transwell显示PFT-α减弱敲低对增殖、迁移、侵袭的抑制。Western blotting显示敲低增加E-cadherin、降低N-cadherin和vimentin,提示抑制上皮-间质转化(epithelial–mesenchymal transition, EMT),PFT-α逆转这些变化。流式细胞术显示敲低增加G
1期细胞、减少S期,PFT-α减弱。Western blotting显示总p53和磷酸化p53、p21增加,CDK2和Cyclin E1降低,p-p53/p53比值无显著改变;PFT-α减弱p53和p21增加并恢复CDK2和Cyclin E1。
3.5 ARMCX3敲低在体外增强顺铂诱导的凋亡和DNA损伤并与p53信号相关:流式细胞术显示顺铂增加凋亡,ARMCX3敲低进一步增强,PFT-α减弱该增强但对照细胞凋亡没有显著影响。彗星实验显示敲低细胞顺铂后DNA碎片增加,olive tail moment升高,PFT-α减弱。Western blotting显示顺铂增加敲低细胞p53和p-p53,PFT-α减弱;γ-H
2AX积累在敲低细胞增加,PFT-α降低。顺铂处理后敲低细胞p-ATM和p-DNA-PKcs及比值降低,总ATM和DNA-PKcs无明显变化,PFT-α部分恢复磷酸化及比值。
3.6 ARMCX3敲低抑制体内乳腺肿瘤生长且该效应被PFT-α减弱:稳定敲低MCF-7和MDA-MB-231细胞皮下植入裸鼠后,肿瘤大小和终末质量较对照减少,PFT-α给药显著减弱生长抑制。H&E显示敲低肿瘤结构破坏和细胞密度降低,PFT-α部分缓解;IHC显示Ki67阳性细胞减少,cleaved-Caspase3免疫反应增加,PFT-α逆转这些变化。每组6只小鼠。
讨论与结论:讨论指出ARMCX3缺失抑制恶性表型和增强顺铂敏感性,回补逆转;转录组和分子实验提示p53相关信号是ARMCX3缺失后的显著分子反应,PFT-α减弱多个表型和分子变化,提供药理学证据。p53协调细胞应激,p21依赖G
1/S检查点阻滞,限制EMT相关程序。ARMCX3缺失增加p53靶基因、CDKN1A/p21,降低CDK2和Cyclin E1,导致G
1期积累,PFT-α减弱这些变化。顺铂诱导DNA损伤,p53协调修复与凋亡;ARMCX3缺失增强p53磷酸化和凋亡,增加γ-H
2AX和DNA碎片,降低ATM和DNA-PKcs磷酸化,PFT-α减弱。ERK信号变化作为探索性结果置于补充信息,trametinib表型未显示清晰挽救。研究在TP53野生型MCF-7和TP53 R280K突变MDA-MB-231中均观察到p53相关反应,但MDA-MB-231中p53蛋白增加不应解释为恢复经典野生型TP53功能。局限包括PFT-α特异性有限、仅两种细胞系、单一shRNA、体内未评估顺铂增强反应、公共数据未独立临床验证。结论翻译:总之,本研究表明ARMCX3缺失抑制乳腺癌细胞增殖、迁移、侵袭和肿瘤生长,同时在体外增强顺铂敏感性。转录组和分子分析表明ARMCX3缺失与p53蛋白丰度增加及p53相关信号改变相关。ARMCX3敲低增加p21表达并诱导G
1期细胞周期阻滞,符合p53相关细胞周期调控反应变化。此外,ARMCX3缺失与DNA损伤反应信号改变及顺铂处理后凋亡增强相关。总体而言,这些发现为ARMCX3在乳腺癌中的生物学功能提供了新见解,并支持进一步研究其与顺铂反应性的潜在相关性。