简要摘要
小型且孤立的野生哺乳动物种群常常因近亲繁殖而导致生存率和繁殖率下降，有害的遗传变异也会被表达出来。现代基因组学工具比传统的家系法能更精确地衡量近交程度。本综述解释了这些基因组学指标如何帮助识别近交与严重适应性问题的关联，以及哪些种群因过去的自然选择或种群历史而表现出缓冲效应。我们总结了陆地和海洋哺乳动物的证据，并讨论了遗传信息如何指导实际保护措施（如有管理的基因流动即"遗传拯救"），同时强调现有证据的局限性。这些见解可以帮助保护工作者判断何时以及如何干预，以确保受威胁的哺乳动物种群在不断变化的世界中保持生命力。
摘要
近交衰退是对野生哺乳动物种群广泛存在但高度变化的威胁，尤其影响小型、孤立或破碎化的种群。基因组学工具现在能够比家系或少数遗传标记更精确地估算个体的近交程度和突变负荷。它们表明，相同水平的纯合度可能带来截然不同的适应性后果。在这篇结构化叙述性综述中，我们考察了纯合子游程（runs of homozygosity）、基因组近交系数和突变负荷与野生哺乳动物近交衰退之间的关系。我们区分了近交（过程）、纯合度（其基因组后果）、低遗传多样性和近交衰退（适应性结果），并强调仅凭高纯合度本身并不能证明存在适应性代价。我们比较了陆地和海洋的实例研究，其中高纯合度与繁殖、存活和抗病力下降相关联；也有案例表明清除选择或种群历史可能限制了适应性的下降。我们探讨了环境压力、方法学差异和混杂因素如何影响所观察到的近交与适应性之间的关系。随后，我们讨论了基因组学估算如何为保护决策提供依据，包括遗传拯救的局限性，并确定了研究优先事项，如结合基因组学、种群学和生态学数据的长期研究。本综述提供了一个框架，用于在保护规划中审慎地解读基因组近交指标。
