在对比盐度和氧化还原条件下，AOA、AOB和comammox受栖息地与深度依赖的功能分化

《Bioresource Technology》：Habitat- and depth-dependent functional partitioning of AOA, AOB, and comammox under contrasting salinity and redox conditions

　　## 论文概要（中文总结）### 研究主题本研究整合 **amoA 基因丰度、amoA 转录本丰度** 以及 **抑制剂分区潜在氨氧化速率**，解析氨氧化古菌（AOA）、氨氧化细菌（AOB）和完全氨氧化菌（comammox）在三种不同生境中的生态位分异。### 采样地点- **潮间带沉积物**：青岛王家庄潮间带，2024年9月（高、中、低潮坪各2个采样点）- **盐渍化土壤**：青岛红岛海水稻种植基地，2024年10月- **农业土壤**：胶州代表性农田，2024年10月### 主要发现1. **高盐潮间带沉积物**中 comammox 的基因和转录本丰度最高，贡献了约 **54–85%** 的估算氨氧化量；三个层面（DNA、RNA、过程）一致性最强。2. **盐渍化土壤**中 AOA 贡献了 **47–59%** 的氨氧化，尽管 AOB 基因丰度更高。3. **农业土壤**中 comammox、AOA 和 AOB 呈现**深度依赖性**的转换格局。4. 基因丰度、转录本丰度与潜在硝化速率之间存在解耦现象，仅凭单一指标无法可靠推断功能优势类群。### 关键环境驱动因子- **盐度**：主要环境筛选因子，对不同氨氧化类群影响不均等- **氧化还原电位（ORP）**：影响氧气渗透与底物传输，改变微生物实际生态位- 盐度与 ORP 常与 pH、总有机碳（TOC）、无机氮等**共变异**，应视为综合生境筛选的组成部分而非独立因果驱动因子### 研究意义该研究首次在高盐潮间带沉积物、盐渍化土壤和农业土壤之间进行了 AOA、AOB 和 comammox 的**直接对比**，强调了 DNA、RNA 和过程水平测量的**联合使用**对于解析功能优势性的重要性。### 作者与资助- **作者**：Yuxin Lan（兰雨欣）、Xue Lou（楼雪）、Yuting Zhai（翟雨婷）、Hui Liu（刘慧）、Shuai Liu（刘帅）、Weijian Liu（刘伟健）、Hui Chen（陈辉）- **资助**：国家自然科学基金（52370172）、泰山学者青年人才计划（tsqn202312203）