综述：阿尔茨海默病分子数据的因果推断方法综述：从关联到治疗靶点的研究进展

《Alzheimer's Research & Therapy》：Causal analysis of Alzheimer’s disease molecular data

　　

摘要

背景

全基因组研究揭示了阿尔茨海默病（AD）的许多分子关联，但关联本身并不能确定病因、机制或可治疗靶点。本综述调查了用于从 AD 分子数据推断因果关系的方法，并评估了其核心发现。

正文

我们回顾了应用于 AD 遗传学、转录组学、表观基因组学、蛋白质组学和代谢组学的因果推断工作，涵盖了孟德尔随机化、概率图模型和贝叶斯网络模型、基于知识图谱的因果推理、包括格兰杰因果性在内的时序解析方法以及中介分析。遗传工具和 网络方法已识别出候选因果分子，绘制了通路，并支持了一些药物靶点。然而，观察性研究报告的几项关联未得到遗传学分析的支持，且研究之间表面上的不一致往往反映了估计量、遗传工具来源的组织或所用方法假设的差异。

结论

需要与大脑相关的遗传工具、纵向多组学、单细胞分辨率以及跨方法的三角验证，以区分原因与结果，并优先确定需实验验证的干预靶点。