整合多组学揭示 FOXO3-SWI/SNF 网络在 DNA 损伤诱导的细胞衰老中的染色质调控机制

《Communications Biology》：FOXO3 induces chromatin changes in a model of DNA damage-induced senescence

　　

摘要

FOXO转录因子在维持细胞稳态和应激反应中起着关键作用，并且已被发现与多个物种的长寿有关。然而，这些因子在人类细胞中不同条件下如何在染色质水平发挥作用仍知之甚少。本文采用整合的多组学方法，鉴定了FOXO3在复制细胞和细胞衰老模型中协调转录程序所涉及的染色质水平机制。在DNA损伤诱导的衰老过程中，FOXO3水平在衰老进入早期即显著升高。FOXO3表达的增加诱导了染色质重塑因子的表达，并与SWI/SNF染色质重塑因子共同影响全基因组的染色质可及性。随着细胞进入DNA损伤诱导的衰老阶段，FOXO3对于染色质重塑以及一个调控细胞应激和谱系特异性细胞功能的基因组网络的重编程至关重要。综上所述，我们鉴定出一个FOXO3-SWI/SNF网络，该网络调控着包括代谢、蛋白质稳态、表观遗传学和细胞谱系在内的关键细胞过程，并在DNA损伤条件下受到动态调控。