快速魔角旋转固体核磁共振解析依非韦伦(EFV):芳香碳C3/C4归属校正与晶胞分子不对称性诊断

《Magnetic Resonance Letters》:Fast-MAS solid-state NMR of efavirenz: Insights into spectral assignments and molecular asymmetry

【字体: 大 中 小 】 时间:2026年10月19日 来源:Magnetic Resonance Letters 2.6

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  固态核磁共振(solid-state nuclear magnetic resonance, NMR)波谱学是表征药物固体的有力技术,但谱峰归属的不一致性可能阻碍准确的结构解析。在本研究中,研究人员通过采用37 kHz的快速魔角旋转(magic-angle s

  
固态核磁共振(solid-state nuclear magnetic resonance, NMR)波谱学是表征药物固体的有力技术,但谱峰归属的不一致性可能阻碍准确的结构解析。在本研究中,研究人员通过采用37 kHz的快速魔角旋转(magic-angle spinning, MAS),重新考察了广泛使用的抗HIV药物依非韦伦(efavirenz, EFV)的固态NMR。通过结合一维(1H、19F、13C)和二维相关(13C–1H与13C–19F)实验,研究人员解决了此前存在争议的归属。关键的是,研究人员校正了芳香C3和C4共振的误归属;该校正通过二维13C–1H相关谱中关键的HN-C4邻近关系得到明确证实。19F谱显示两个不同峰,积分比为1:2,直接反映晶胞中三个晶体学独立分子,并为分子不对称性提供简便诊断。19F检测的13C–19F相关进一步区分碳环境。该工作不仅纠正了此前的归属错误,还建立了一种稳健的多核方法,整合1H、13C和19F NMR,用于氟化药物的详细分析。
药物固体常呈现多晶型(polymorphism)、部分结晶和局部无序,这些因素会影响活性药物成分(active pharmaceutical ingredient, API)的稳定性、溶解度和生物利用度。X射线衍射(X-ray diffraction, XRD)可用于确定长程晶体有序,但在检测局部结构变异、分子动力学和无序组分方面存在固有局限。固态核磁共振(solid-state nuclear magnetic resonance, NMR)能够提供原子级分子构象以及分子内和分子间相互作用信息,与XRD互补,因此在药物综合表征中具有关键作用。依非韦伦(efavirenz, EFV)是一种非核苷类逆转录酶抑制剂,仍是HIV一线治疗的中坚药物,并被列入世界卫生组织(World Health Organization, WHO)基本药物目录。EFV分子含有-NH和C=O基团,可形成氢键,因而具有丰富的固相化学和多种晶体堆积模式;迄今已发现超过23种不同的多晶型、溶剂化物和无定形相,使其成为固态NMR深入研究的理想对象。

既往13C交叉极化/魔角旋转(cross-polarization/magic-angle spinning, CP/MAS)研究已用于EFV研究。Gomes等观察到EFV与拉米夫定物理混合时固态NMR化学位移变化,提示两药不相容;该结果由差示扫描量热法(differential scanning calorimetry, DSC)和热光学分析(thermo-optical analysis, TOA)提示,但傅里叶变换红外光谱(Fourier-transformed infrared spectroscopy, FT-IR)未显示。其谱图在4 kHz MAS下采集,分辨率有限且受旋转边带严重干扰。Fandaruff等研究EFV两种无水多晶型(form I和II),发现form I的13C谱共振数目多于form II,与不对称单元中存在三个分子一致;其在相对低磁场(300 MHz)下观察到源于四极核(14N和35Cl/37Cl)残留偶极耦合的线宽,并用CP和非季碳抑制(non-quaternary suppression, NQS)给出尝试性归属。然而,后续研究表明,其对三氟甲基(-CF3)和大多数芳香碳(除C3外)的归属仍模糊或似有误。Sousa等随后对经不同处理程序的EFV样品开展更全面研究,使用13C固态NMR以及1H、13C和二维13C–1H溶液NMR重新考察归属差异,尤其根据特征性13C–19F J分裂将C14共振校正至123.2 ppm。然而,其对C3和C4的归属与其自身密度泛函理论(density functional theory, DFT)计算化学位移相矛盾,使这些具体归属仍未解决。基于已有归属,Szell等用变温和弛豫实验并结合DFT研究EFV及其系列共晶动力学,发现EFV-L-脯氨酸共晶中环丙基运动显著受限。Braga等用13C谱探索γ-环糊精对EFV溶解度的影响。Yadav等表征EFV-烟酰胺共晶,报道所有碳原子相对纯EFV的峰位移,其中C6最大位移为1.28 ppm。尽管已有大量努力,文献中仍存在不一致,尤其是EFV form I芳香碳C3和C4的归属。先前归属似乎主要基于溶液NMR,缺乏充分的固态NMR验证;一维谱通常不足以明确归属芳香碳,多核相关实验对于确定性谱图解析必不可少。因此,研究人员在37 kHz相对快速MAS下对EFV form I开展综合固态NMR研究,除常规13C实验外,还获取高分辨1H和19F谱,并采用二维13C–1H和13C–19F相关实验解决此前归属歧义。具体而言,研究人员利用空间邻近的13C–1H相关校正C3和C4误归属,并证明19F谱可简单、定量地测量晶胞内分子不对称性。该研究不仅细化EFV结构描述,也展示了一种在快速MAS下用多核固态NMR研究氟化药物的通用方法。

关键技术方法概括如下:样品为购自Yuan Ye Biotechnology Co., Ltd.的EFV form I粉末(CCDC 767883),约6 mg装入1.6 mm转子。所有固态NMR实验在Bruker AVANCE NEO 600 MHz(14.1 T)谱仪上完成,MAS频率为37.037 kHz;采用1H–13C和19F–13C交叉极化(CP)、长/短接触时间一维13C CP/MAS、1H和19F一维谱、二维13C–1H与13C–19F异核相关、19F反转恢复测量纵向弛豫时间(T1),并以溶液1H NMR辅助。化学位移分别以金刚烷和三氟乙酸铵为参照。

3.1. 1H、13C与二维13C–1H谱
研究人员首次报道EFV固态1H谱。该谱分辨率虽低于溶液谱,但可清晰区分质子类型:酰胺质子(HN,9.2 ppm)、芳香质子(7.0–8.0 ppm)和环丙基质子(?0.3–1.6 ppm)。9.2 ppm共振基于其典型低场化学位移及其与CDCl3中EFV溶液1H NMR谱的接近对应关系归属为HN;其余共振可参照溶液NMR归属。值得注意的是,亚甲基质子(H12/H13)在固态中相较溶液约0.9 ppm发生高场位移至?0.3 ppm,作者将其归因于晶体内分子间环电流效应。长接触时间(2 ms)1H–13C CP谱显示所有碳,且因600 MHz更高磁场而较既往报道分辨率改善;短接触时间(0.05 ms)CP选择性增强质子化碳,显示芳香C5、C6和C8强信号,而质子化C11、C12和C13信号相对较弱,这与晶体结构中环丙基的高迁移性一致。19F–13C CP强烈增强靠近氟的碳,如三氟甲基(-CF3)碳C14(123.1 ppm)和C2(79.6 ppm)。重要的是,C14在1H–13C谱中因13C–19F J耦合呈清晰四重峰,但在同时1H和19F去耦下坍缩为单峰,从而确认其归属;此前文献中C14曾被误归属至114.6 ppm或128.0 ppm。

芳香碳C3和C4的归属长期不一致。早期报道将134.3/134.9 ppm峰归为C3、114.4 ppm归为C4,似基于溶液HMBC数据;但这些解释可疑,因为其与自身DFT计算矛盾,后者预测C3在121.4/123.0 ppm、C4在138.4/138.9 ppm,且δC4–δC3大于15 ppm。为消除歧义,研究人员采集二维13C–1H异核相关谱,使用0.8 ms CP接触时间观察HN与邻近碳的相关。HN与C1在(147.5, 9.2) ppm出现强相关,对应已知分子内距离1.9 ?;在(134.5, 9.2) ppm也出现明显相关,研究人员依据分子内距离2.0 ?将其归为C4–HN相关。相较之下,C3–HN距离为3.2 ?,使相应交叉峰显著更弱甚至不可检测。虽然C1和C4都靠近HN,但可通过其充分分离的13C化学位移范围和交叉峰强度差异区分;C1仅靠近HN,而C4同时靠近HN和H5(距离均为2.0 ?),因此第二次CP步骤中C4磁化分布在C4–HN和C4–H5路径,使C4–HN交叉峰弱于C1–HN交叉峰。C4确定后,芳香碳中仅剩C3和C7;C5、C6和C8为质子化碳并由短CP识别,C7与Cl相连因而出现在更大化学位移处,因此C3可归属在约114 ppm。该归属还得到19F–13C CP中C3信号更强的支持,因为C3比C7更接近-CF3基团。由此,这些实验明确确立134.5/135.3 ppm碳峰属于C4,而114.5/114.8 ppm碳峰属于C3,从而纠正早先文献归属。三维图神经网络快速预测将C4置于137.2 ppm、C3置于119.2 ppm,与实验归属一致;此外,14N编辑技术也可确认C3和C4归属,但需要1H–13C–14N三共振探头。600 MHz下增强的分辨率还揭示若干碳的分裂(C1、C4、C5、C8、C9、C10和C11-C13),研究人员将其归因于不对称单元中三个晶体学不等价分子的存在。二维13C–19F归属进一步给出不同19F位点下部分碳环境差异,例如C1在147.2、147.5、147.8 ppm,C3在114.5、114.8 ppm,C4在134.5、135.3 ppm,C14在123.1 ppm等。

3.2. 19F与二维13C–19F谱
对于氟化化合物,19F NMR具有高灵敏度(与1H相当)和来自辅料的可忽略背景,因此适合定量。EFV的19F谱在不到1分钟内采集,信噪比(signal-to-noise ratio, SNR)超过2200,显示两个分辨良好的峰,分别在?81.5和?82.6 ppm。峰A和B/C的19F T1值分别测定为0.56±0.03和0.55±0.03 s。两峰积分比为1:2,与Szell等报道一致,直接反映不对称单元中存在三个晶体学独立分子,为分子不对称性提供简单快速的19F NMR验证。此处A、B、C仅作为晶胞中三个分子的标签,不应被理解为与晶胞中特定位置分子一一对应。Szell等还证明DFT计算预测19F化学位移差小于0.5 ppm;尽管该差异在一维19F实验谱中无法分辨,但可在二维13C–19F相关谱中揭示。

二维13C–19F相关谱采用19F检测脉冲序列采集。由于19F相对13C具有更高旋磁比(γF/γC≈3.74),在考虑50% 13C–19F转移效率时,19F检测固有地提供约3.6倍于13C检测的灵敏度优势。类似的19F检测13C–19F TEDOR实验此前已用于19F标记GB1的距离测量;然而对于相关实验,CP预计比TEDOR对13C–19F对提供更高效率,更适合快速MAS条件。二维13C–19F谱进一步分辨每个19F位点的碳环境。例如,C14(-CF3)与两个19F峰相关,对构象A和B/C显示略有不同的化学位移(123.2 vs. 123.0 ppm);同样,C2、C3、C4、C8和C9显示分辨的相关,能够将部分峰归属至特定构象。涉及环丙基碳的某些相关未观察到,且有限SNR阻止所有碳的完全归属。尽管如此,二维谱提供有价值的补充信息,确认19F环境与衍射推导的不对称单元匹配,并有助于区分不同构象的碳。?82.6 ppm的19F峰分裂为约?82.5和?82.7 ppm两个共振,观测分裂约0.2 ppm,与Szell等报道的DFT计算定性一致,该计算也预测两个构象对应两个不同19F共振,尽管计算得到的19F化学位移差略大。该分裂在一维谱中未分辨。总体而言,19F检测二维13C–19F相关实验为构象依赖环境提供敏感探针,补充一维NMR、晶体学和DFT数据。

讨论部分总结:本研究中,二维13C–1H和13C–19F相关谱为分析EFV提供良好基础。进一步实验,如二维1H–19F和三维19F–19F–1H相关,可能提供长程约束和分子构象的额外信息;这些在未来更快MAS频率下值得开展。

研究结论翻译:该工作提供了在快速MAS(37 kHz)下EFV form I的改进固态NMR归属。研究人员首先通过二维13C–1H实验中直接检测到的C4–HN邻近,明确重新归属了芳香C3和C4共振。该归属与结构距离和计算预测一致,解决了文献中长期存在的矛盾。随后,研究人员利用两个具有1:2积分比的不同19F峰探测分子不对称性,这直接反映晶胞中存在三个独立分子。此外,二维13C–19F相关进一步区分了对应不同分子构象的碳环境,展示了19F检测实验用于快速和灵敏分析的能力。快速MAS与多核实验的综合使用,为氟化药物的详细固相表征提供了稳健策略,并与质量控制直接相关。
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