《Blood Advances》：Chromatin-informed cell-free DNA approach for detection of clinically measurable disease in multiple myeloma
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摘要多发性骨髓瘤(MM)的监测使用基于骨髓的微小残留病(MRD)检测，这些检测具有较高的敏感性，但需要反复的侵入性采样，且仅限于单一解剖部位。游离DNA(cfDNA)提供了一种微创替代方案，但大多数cfDNA方法依赖于先前的肿瘤分析，以识别患者特异性的基因组改变，以便在血浆中
摘要
多发性骨髓瘤(MM)的监测使用基于骨髓的微小残留病(MRD)检测，这些检测具有较高的敏感性，但需要反复的侵入性采样，且仅限于单一解剖部位。游离DNA(cfDNA)提供了一种微创替代方案，但大多数cfDNA方法依赖于先前的肿瘤分析，以识别患者特异性的基因组改变，以便在血浆中进行后续追踪。在这里，我们开发了MATADOR，一种针对多发性骨髓瘤的特异性、与肿瘤无关的框架，它利用固定在多发性骨髓瘤特异性染色质可及调控区域的cfDNA片段化模式。这些区域是使用独立MM队列的单核ATAC-seq数据定义的，用于在没有患者特异性肿瘤分析的情况下量化这些位点的血浆cfDNA片段化。仅使用这些位点特异性特征，MATADOR在保留的测试集中区分了临床上可测量和不可测量的疾病，其接收者操作特征曲线下面积(AUROC)为0.94。这些发现确立了染色质指导的cfDNA片段组学作为一种微创方法，用于在没有个体化肿瘤分析的情况下评估MM的疾病，使得血液基础疾病评估能够超越骨髓采样的限制。
Palak Bajaj|Dor D. Abelman|Ping Luo|Michele Ceccarelli|Jonathan H. Schatz|Dionysios C. Watson|Chrissy Baker|Ava Amidei|Edus H. Warren|Benjamin Diamond|Alexander Lesokhin|Neha Korde|Urvi A. Shah|Sham Mailankody|Hani Hassoun|Eric Smith|Dickran Kazandjian|Sacha Gnjatic|Trevor J. Pugh|Damian J. Green|David G. Coffey
西尔弗斯特综合癌症中心，迈阿密大学米勒医学院，佛罗里达州迈阿密市，美国
