《Frontiers in Pharmacology》:Inhibition of cytochrome P450 activities by juglone in human and rat liver microsomes: kinetic characterization and implications for natural product–drug interaction assessment
编辑推荐:
专业摘要翻译:
背景:胡桃醌是核桃青皮中的一种氧化还原活性成分,但其对药物代谢细胞色素P450(CYP)酶的影响尚未被完全表征。方法:研究人员使用混合探针底物法、时间依赖性抑制实验、动力学分析和分子对接,评估了胡桃醌对人肝微粒体(HLMs)和大鼠肝微粒体(RL
专业摘要翻译:
背景:胡桃醌是核桃青皮中的一种氧化还原活性成分,但其对药物代谢细胞色素P450(CYP)酶的影响尚未被完全表征。方法:研究人员使用混合探针底物法、时间依赖性抑制实验、动力学分析和分子对接,评估了胡桃醌对人肝微粒体(HLMs)和大鼠肝微粒体(RLMs)中六种CYP活性的影响。结果:在HLMs中,CYP2C9是最敏感的活性(IC50 = 8.12 μM;Ki = 4.97 μM),并表现为竞争性抑制。CYP2E1为次敏感活性(IC50 = 12.67 μM;Ki = 19.59 μM;αKi = 8.74 μM),并表现为混合型抑制。在RLMs中,CYP1A2(IC50 = 12.03 μM)和CYP2E1(IC50 = 18.50 μM)满足了预设的进一步动力学分析标准。后续分析确定了CYP1A2的混合型抑制(Ki = 12.31 μM)和CYP2E1的竞争性抑制(Ki = 19.89 μM)。在测试条件下,预孵育20分钟内未观察到一致性的活性进行性丧失。CYP2E1在HLMs和RLMs中表现出数值相近的表观Ki,但拟合的抑制模型不同。然而,不同的实验条件使得这些差异不能单纯归因于物种差异。分子对接为胡桃醌与CYP2C9之间的潜在相互作用提供了定性结构见解。结论:胡桃醌在体外抑制CYP活性,其中CYP2C9在所测六种人CYP活性中敏感性最高。这些发现表征了其生化抑制特征,并为评估含胡桃醌产品潜在的代谢相互作用提供了基础。
论文解读:
细胞色素P450(CYP)酶超家族是外源性物质包括临床药物和体内化合物发生I相氧化代谢的主要酶系统,其中CYP1A2、CYP2B6、CYP2C9、CYP2D6、CYP2E1和CYP3A4对药物生物转化有重要贡献。天然产物和膳食补充剂也可能通过抑制CYP酶而改变合并用药的代谢清除和全身暴露,因此评估其抑制作用具有药物相互作用风险提示意义。胡桃醌是核桃青皮(中药青龙衣)中的氧化还原活性萘醌成分,具有抗菌、抗炎、抗肿瘤活性,并可作为先导化合物骨架。尽管其结构相关的萘醌类化合物如胡桃醌的同类物已报道具有CYP抑制效应,但胡桃醌自身的CYP酶抑制谱、抑制类型、是否存在时间依赖性失活以及人鼠微粒体间的差异仍未明确。该研究针对这一知识空白,系统评估了胡桃醌在HLMs和RLMs中对六种CYP活性的抑制作用,以确定其敏感性谱和动力学特征,并为进一步的暴露-抑制关系评估提供生化基础。
研究人员使用混合探针底物法在HLMs和RLMs中筛选胡桃醌对CYP1A2、CYP2B6/2B1、CYP2C9/2C11、CYP2D6/2D1、CYP2E1和CYP3A4/3A2的抑制效果;对IC
50低于20 μM的活性开展两阶段预孵育时间依赖性评估和动力学表征;并借助分子对接获得CYP2C9和CYP2E1结合模式的定性结构信息。关键结果显示,HLMs中CYP2C9和CYP2E1最敏感,RLMs中CYP1A2和CYP2E1最敏感,但未观察到一致的时间依赖性失活。动力学分析进一步明确了各敏感CYP的抑制类型和表观常数。这些结果将CYP2C9确定为人源CYP中最优先的关注靶点,为含胡桃醌产品的相互作用风险评估提供了实验依据。
关键技术方法:研究所用样本包括商业化混合性别人肝微粒体(BioIVT,150名供体,男74名女76名,年龄10个月至85岁)和研究人员实验室自备的混合大鼠肝微粒体(10只雄性SD大鼠,200–250 g)。采用六种CYP选择性探针底物的cocktail法同时测定代谢物形成;应用LC-MS/MS进行代谢物定量;通过变斜率非线性回归计算IC
50;采用两阶段预孵育法筛选时间依赖性抑制;对选定的CYP活性使用四水平底物和四水平抑制剂浓度设计进行动力学实验,结合Lineweaver–Burk双倒数图、二级重作图和全局非线性回归(AICc模型比较)估计K
i和αK
i;分子对接采用Glide标准精度模式,受体结构来自PDB(人CYP2C9 5W0C、人CYP2E1 3E6I)。
研究结果各小节主要内容如下:
胡桃醌对HLMs和RLMs中CYP活性的抑制作用:浓度-效应筛选显示,在HLMs中CYP2C9抑制最强(IC
50 = 8.12 μM),CYP2E1次之(IC
50 = 12.67 μM),CYP1A2和CYP2B6敏感性中等,CYP2D6和CYP3A4在1–100 μM范围未达到50%抑制。在RLMs中,CYP1A2(IC
50 = 12.03 μM)和CYP2E1(IC
50 = 18.50 μM)达到进一步动力学分析标准,CYP2B1、CYP3A2、CYP2C11和CYP2D1敏感性依次降低。
胡桃醌对HLMs和RLMs中CYP时间依赖性抑制的评价:对HLMs的CYP2C9、CYP2E1和RLMs的CYP1A2、CYP2E1进行预孵育0–20分钟实验,未发现残留活性随预孵育时间出现一致的进行性下降,因此在测试条件下未观察到时间依赖性CYP失活的证据。
胡桃醌对HLMs和RLMs中CYP抑制的动力学特征:动力学分析显示,HLMs中CYP2C9为竞争性抑制,表观K
i = 4.97 μM;CYP2E1为混合型抑制,表观K
i = 19.59 μM,αK
i = 8.74 μM,α = 0.45。RLMs中CYP1A2为混合型抑制,表观K
i = 12.31 μM,αK
i = 19.64 μM,α = 1.60;CYP2E1为竞争性抑制,表观K
i = 19.89 μM。互补的非线性拟合与二级重作图结果大致一致,且CYP2C9的K
i在所有进行动力学的人源CYP中最低。
胡桃醌与人CYP2C9和CYP2E1的分子对接:分子对接得到CYP2C9的GlideScore为?6.758 kcal/mol,CYP2E1为?7.502 kcal/mol。最高排名的CYP2C9结合姿态将胡桃醌置于血红素催化中心附近,预测与Phe114及多个疏水残基存在接触,并可能形成Arg108与羰基的氢键。这些预测接触未经实验验证,仅作为后续结构研究的定性假设,不用于确定抑制类型或抑制效能排序。
讨论部分总结:该研究将CYP2C9确定为人肝微粒体六种被测CYP活性中最易受胡桃醌抑制的亚型,其IC
50和表观K
i分别约为8.12 μM和4.97 μM,对应名义体外浓度约1.41和0.866 μg/mL。由于目前缺乏胡桃醌在人体内原型药物暴露的可靠数据,无法将上述体外抑制常数直接转化为临床相互作用风险预测;未来需测定非结合型原型胡桃醌浓度并开展结合校正的暴露-抑制评估。HLMs和RLMs中CYP2E1的表观K
i数值相近,但拟合抑制模型不同,这种差异可能源于微粒体蛋白浓度和缓冲液组成等实验条件的不同,而不能简单归因于物种差异。大鼠肝微粒体CYP2C11不是人CYP2C9的一一对应同源物,因此大鼠谱适用于设计大鼠研究,但不能作为人CYP2C9的定量替代。时间依赖性实验未显示一致失活,但预孵育时间较短且未设专一阳性对照,尚不能排除可逆性之外的机制失活可能。与同实验室先前研究的胡桃醌同类萘醌相比,胡桃醌并非对全部六种人CYP均匀抑制,而主要靶向CYP2C9和CYP2E1,表明仅凭结构相似性不能推断CYP抑制谱。分子对接得分与实验抑制等级不一致,说明对接仅产生结构假设而非亲和力数值。全局非线性回归分析进一步支持CYP2C9在人体内被测CYP中具有最低K
i,但各常数仍是依赖方法学条件的表观参数。
研究结论翻译:本研究表征了胡桃醌对人肝微粒体和大鼠肝微粒体中六种CYP活性的体外抑制作用。在人源六种CYP活性中,CYP2C9敏感性最高,IC
50为8.12 μM,表观K
i为4.97 μM。HLMs和RLMs中观察到不同的抑制谱,但微粒体蛋白浓度和缓冲液组成的差异使得这些差异不能仅归因于物种因素。临床相互作用风险的评估需要人胡桃醌暴露数据和结合校正后的抑制参数。总之,这些发现表征了胡桃醌的生化CYP抑制特征,为后续评估其潜在代谢相互作用提供了实验基础,并确定CYP2C9为优先研究对象。