基于ERIC-PCR和(GTG)?-PCR指纹图谱对多来源多重耐药大肠埃希菌耐药性与分子亲缘关系的研究

《Annals of Microbiology》：Comparative evaluation of ERIC-PCR and (GTG)?-PCR for genetic diversity analysis of multidrug-resistant Escherichia coli from clinical, environmental, and food sources

【字体：大中小】 时间：2026年10月20日 来源：Annals of Microbiology 5.1

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　　摘要目的多重耐药（MDR）大肠埃希菌在临床、环境和食品来源中的出现和传播，在“健康一体”框架下构成了重大的公共卫生挑战。本研究使用 ERIC-PCR 和 (GTG)?-PCR 指纹图谱技术，比较了这些生态位中分离的大肠埃希菌的抗菌素耐药性、遗传多样性和分子亲缘关系。材料与方法

摘要

目的

多重耐药（MDR）大肠埃希菌在临床、环境和食品来源中的出现和传播，在“健康一体”框架下构成了重大的公共卫生挑战。本研究使用 ERIC-PCR 和 (GTG)?-PCR 指纹图谱技术，比较了这些生态位中分离的大肠埃希菌的抗菌素耐药性、遗传多样性和分子亲缘关系。

材料与方法

共分离出 120 株大肠埃希菌，其中选取 68 株多重耐药株（临床 n = 21，环境 n = 23，食品 n = 24）进行抗菌素敏感性测试、多重抗生素耐药（MAR）指数测定、β-内酰胺酶和碳青霉烯酶基因的 PCR 检测，以及使用 ERIC-PCR 和 (GTG)?-PCR 进行分子指纹图谱分析。通过构建树状图和主成分分析对遗传关系进行分析。

结果

所有来源中均观察到高水平的多重耐药性，临床分离株的 MDR 流行率为 100%，环境分离株为 91.3%，食品分离株为 79.2%。bla_NDM 基因是主要的耐药决定因子。两种指纹图谱方法均显示出较大的遗传多样性，同时几个分离株聚类在不同样本来源间表现出中等程度的遗传相似性。(GTG)?-PCR 方法对环境分离株和食品分离株显示出更高的鉴别性能，而两种方法在临床分离株中显示出相当的鉴别能力。

结论

MDR 大肠埃希菌的广泛存在，以及所研究来源中相似耐药基因谱的存在，加上缺乏明显的来源特异性聚类，表明不同来源的分离株之间可能存在遗传亲缘关系。这些发现支持在“健康一体”框架下应用分子指纹图谱进行抗菌素耐药性监测。

目的

多重耐药（MDR）大肠埃希菌在临床、环境和食品来源中的出现和传播，在“健康一体”框架下构成了重大的公共卫生挑战。本研究使用 ERIC-PCR 和 (GTG)?-PCR 指纹图谱技术，比较了这些生态位中分离的大肠埃希菌的抗菌素耐药性、遗传多样性和分子亲缘关系。

材料与方法

共分离出 120 株大肠埃希菌，其中选取 68 株多重耐药株（临床 n = 21，环境 n = 23，食品 n = 24）进行抗菌素敏感性测试、多重抗生素耐药（MAR）指数测定、β-内酰胺酶和碳青霉烯酶基因的 PCR 检测，以及使用 ERIC-PCR 和 (GTG)?-PCR 进行分子指纹图谱分析。通过构建树状图和主成分分析对遗传关系进行分析。

结果

所有来源中均观察到高水平的多重耐药性，临床分离株的 MDR 流行率为 100%，环境分离株为 91.3%，食品分离株为 79.2%。bla_NDM 基因是主要的耐药决定因子。两种指纹图谱方法均显示出较大的遗传多样性，同时几个分离株聚类在不同样本来源间表现出中等程度的遗传相似性。(GTG)?-PCR 方法对环境分离株和食品分离株显示出更高的鉴别性能，而两种方法在临床分离株中显示出相当的鉴别能力。