综述：非编码RNA编码肽：双重调控机制及其在心血管系统中的应用

《Cell Communication and Signaling》：Beyond non-coding: peptide translation and bifunctional RNA biology in cardiovascular disease

摘要

非编码RNA（ncRNAs）传统上被认为是一种缺乏蛋白质编码能力的功能性转录本。然而，转录组学和蛋白质组学的进展表明，某些ncRNAs包含能够生成生物活性肽的小开放阅读框。最近的研究表明，这些肽参与了多种心血管过程，包括钙代谢、线粒体代谢、组织修复、纤维化、炎症和血管重塑。重要的是，这些发现的意义不仅在于识别出了一类新的肽。越来越多的研究表明，RNA转录本和编码的肽可以共存于同一基因位点，并通过独立、平行、协同或拮抗的机制参与生物调控。这种双重输出结构挑战了编码和非编码转录本之间的传统二元区分，表明一些产生肽的ncRNAs具有双重调控功能。在这篇综述中，我们总结了支持ncRNAs翻译肽的现有证据，并探讨了ncRNA衍生肽在心血管生理和疾病中的新兴作用。此外，我们还探讨了肽翻译如何扩展基因位点的功能输出，使RNA转录本和编码的肽能够通过独立、平行、协同或拮抗的机制参与生物调控。基于这些调控机制，我们提出了一个理解具有双重功能的RNA的概念框架。我们进一步讨论了这种双重调控模式如何为心血管疾病的治疗干预、生物标志物开发和生物工程应用开辟新的途径。

图形摘要

非编码RNA（ncRNAs）传统上被认为是一种缺乏蛋白质编码能力的功能性转录本。然而，转录组学和蛋白质组学的进展表明，某些ncRNAs包含能够生成生物活性肽的小开放阅读框。最近的研究表明，这些肽参与了多种心血管过程，包括钙代谢、线粒体代谢、组织修复、纤维化、炎症和血管重塑。重要的是，这些发现的意义不仅在于识别出了一类新的肽。越来越多的研究表明，RNA转录本和编码的肽可以共存于同一基因位点，并通过独立、平行、协同或拮抗的机制参与生物调控。这种双重输出结构挑战了编码和非编码转录本之间的传统二元区分，表明一些产生肽的ncRNAs具有双重调控功能。在这篇综述中，我们总结了支持ncRNAs翻译肽的现有证据，并探讨了ncRNA衍生肽在心血管生理和疾病中的新兴作用。此外，我们还探讨了肽翻译如何扩展基因位点的功能输出，使RNA转录本和编码的肽能够通过独立、平行、协同或拮抗的机制参与生物调控。基于这些调控机制，我们提出了一个理解具有双重功能的RNA的概念框架。我们进一步讨论了这种双重调控模式如何为心血管疾病的治疗干预、生物标志物开发和生物工程应用开辟新的途径。

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