选择性切割次黄嘌呤的高特异性RNA切割DNAzyme开发及其在RNA编辑检测中的应用

《Chemical Science》：Exploiting inosine as a distinctive cleavage site for deriving a highly specific RNA-cleaving DNAzymeOpen Access

【字体：大中小】 时间：2026年10月20日 来源：Chemical Science 8.1

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大多数RNA切割DNAzyme只能切割四种典型核糖核苷酸之间的各种组合。通过体外筛选，我们分离出ICD11?1T，这是一种能够选择性切割次黄嘌呤（inosine）的DNAzyme，而次黄嘌呤是一种由腺苷脱氨作用产生的非典型RNA修饰。ICD11?1T以0.1 min?1的速率常数切割含次黄嘌呤的底物，对腺苷的识别选择性超过103倍，能够区分嘌呤环C6和N1位不同的核苷。分子动力学模拟显示，次黄嘌呤使切割位点靠近催化核心，而腺苷复合物则将其隔离远离，这解释了其严格的特异性。利用ICD11?1T，我们构建了一种荧光生物传感器，使能够在固定和透化细胞中成像内源性ADAR（作用于RNA的腺苷脱氨酶）编辑活性。本工作为研究腺苷到次黄嘌呤（A-to-I）RNA编辑提供了概念验证工具，并建立了一种扩展DNAzyme功能的策略。