跨物种骨骼肌单细胞适应反应图谱:损伤与过载驱动的结构重塑及组成预测的局限性

《Current Issues in Molecular Biology》:A Cross-Condition Single-Cell Atlas Defines Skeletal Muscle Adaptation and Its Predictive Limits

【字体: 大 中 小 】 时间:2026年10月20日 来源:Current Issues in Molecular Biology 4.1

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   摘要

  

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骨骼肌通过肌纤维和细胞微环境间的协调变化来适应多种应力,但这些反应通常被分开研究。我们汇编了一个跨物种发现图谱,收录了来自六个公共资源的 501,940 个细胞和细胞核,涵盖 2863 个在声明的分析单元水平上定义的条件 - 时间 - 状态组合,并使用两个独立的验证数据集对其进行了评估。损伤产生了最大的观察到的组成位移,其次是机械过载;而急性人类耐力运动和去神经虽然显示出显著的细胞类型特异性分子反应,但仅表现出较小的占比变化。遗传谱系数据鉴定出了不同的新融合肌核程序;过载的 Myomaker 敲除与假手术对照的比较仍受限于载荷、遗传背景和批次差异。空间分析在神经肌肉接头区域周围鉴定出了末端施万细胞表达模块的局部富集,配对的人类数据集提供了依赖设计方案的转化支持。在 20 种仅使用训练集预测变量预处理的固定模型规范中,基线加上下文对照模型相较于仅组成和干预置换对照显示出微小的平均改进,但跨研究留出集的表现存在异质性。在此,我们展示了证据分级图谱在刻画观察到的适应性重塑及依赖研究的基线结构的同时,也能界定基于粗略组成的前瞻性预测的局限性。
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