MARDy 2.0：一个整合抗真菌耐药性数据与蛋白质结构的交互式探索平台

《Bioinformatics》：MARDy 2.0: a platform for exploring and analysing antifungal resistance mutations

　　

摘要

研究动机

抗真菌药物耐药性的上升代表了对全球公共卫生和粮食安全日益增长的重大威胁。因此，了解支撑抗真菌耐药性的遗传和分子机制对于临床管理和农业病害防控都是必不可少的。

结果

我们介绍了 MARDy 2.0，这是一个更新的平台，取代了原始的 Mycology Antifungal Resistance Database。MARDy 2.0 提供了一个交互式平台，用于探索来自社区资源 FungAMR 的抗真菌耐药性数据，以及来自 UniProtKB 的蛋白质结构或使用 AlphaFold 预测的结构。该平台提供了增强的数据探索和分析工具，可通过交互式网页界面免费访问，支持搜索过滤和下载、基于 BLAST 的序列相似性搜索、用于探索性分析的实验性自然语言查询界面、用于在蛋白质上下文中可视化突变的突变图，以及显示突变位置的结构的预测。MARDy 2.0 提供了一个平台，促进抗真菌耐药性进化、监测和缓解策略的研究。使用 MARDy 时应同时使用和引用其整合的底层资源 FungAMR。

可用性

可通过 https://mardy.net 访问