基于ISSR-PCR技术评估临床光滑念珠菌分离株的遗传多样性与系统发育关系

《BMC Microbiology》:Genetic diversity and antimicrobial resistance of Candida glabrata clinical isolates from Odisha, India: An ISSR-PCR study

【字体: 大 中 小 】 时间:2026年10月21日 来源:BMC Microbiology 5.4

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   摘要背景外阴阴道假丝酵母菌病(VVC)是育龄女性中常见的一种真菌感染,主要由白色念珠菌(Candida albicans)引起。非白念珠菌(NAC)菌种,尤其是光滑念珠菌(C. glabrata),因其对抗真菌药物的耐药性日益增强,正逐渐成为条件致病菌。为了监测感染的出现并制

摘要

背景

外阴阴道假丝酵母菌病(VVC)是育龄女性中常见的一种真菌感染,主要由白色念珠菌(Candida albicans)引起。非白念珠菌(NAC)菌种,尤其是光滑念珠菌(C. glabrata),因其对抗真菌药物的耐药性日益增强,正逐渐成为条件致病菌。为了监测感染的出现并制定相应的应对策略,有必要了解光滑念珠菌的遗传变异情况。

目的

本研究旨在利用简单序列重复间聚合酶链反应(ISSR-PCR)评估来自临床样本的光滑念珠菌分离株的遗传多样性和相关关系。

方法

共从印度奥里萨邦布巴内什瓦尔的IMS和SUM医院以及卡林加医院的疑似患者中采集了500份阴道拭子样本。其中,120份被鉴定为光滑念珠菌,并选取了31株具有独特耐药模式的分离株进行进一步的ISSR-PCR和遗传多样性分析。样本在沙氏葡萄糖琼脂(SDA)上培养,随后进行革兰氏染色和念珠菌鉴别琼脂(CDA)培养以确定菌种。采用纸片扩散法检测九种抗真菌药物的敏感性。使用苯酚-氯仿-异戊醇(PCI)法提取基因组DNA。ISSR-PCR使用了19个引物,但仅关注可重复的条带模式。计算了遗传多样性指数,包括多态性、分辨力、引物指数和多样性指数。基于Jaccard相似性系数、层次聚类和主成分分析(PCA)确定系统发育关系。

结果

在分析的500份阴道拭子样本中,共分离出120株光滑念珠菌。抗真菌敏感性测试显示存在大量耐药性,尤其是对氟康唑(70.97%)、酮康唑(67.74%)、伊曲康唑(58.06%)和卡泊芬净(54.84%)的耐药性,而伏立康唑表现出相对较高的活性。根据独特的抗真菌敏感性谱和足够的DNA质量,选取了31株光滑念珠菌分离株进行ISSR-PCR分析。在所选取的分离株中,七个ISSR引物产生了可重复的扩增图谱,显示出遗传相关性的差异。各引物的多样性指数值范围为0.674至0.998,其中ISSR 12的最低值,而其他引物表现出较高的值,表明它们在检测分离株间多态性的能力方面存在差异。热图分析显示,在系统发育和PCA中各组群之间存在明显分离。

结论

研究结果表明,光滑念珠菌样本之间存在大量的遗传变异。ISSR-PCR被证明是一种可靠且经济的技

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